目前，食品微生物檢驗技術還存在較多不足之處，多種食品微生物無法根據相關需求進行檢驗，從而為食品微生物檢驗工作帶來一定難度。雖然國家已對此類技術提出了一定的標準，但在實際應用過程中，仍存在檢驗質量問題，阻礙了國家食品行業的發展。

1.食品污染程度指標菌的檢驗

食品污染程度指標菌的檢驗是食品微生物檢驗技術人員對大腸菌群類的細菌總群、大腸菌群等進行檢驗，在一定程度上評價出飲用水的安全性，進而達到一定的檢驗要求。同時，微生物檢驗人員要注意此類菌群在水與食品中含量標準的不同。

2.檢驗多種致病菌

檢驗多種致病菌是食品微生物檢驗技術人員必須要對食品中的金黃色葡萄球菌等進行檢驗，在此基礎上，食品微生物檢驗人員還要對其進行定量檢驗，為其研究奠定良好基礎。

食品中所含有的微生物種類較多，其檢驗工作環境復雜，所以對采集樣品的要求較高。在食品微生物檢驗過程中，相關檢驗人員必須對其特點進行分析，提高對采集樣品的要求。第一，檢驗人員必須對食物中含有的病原型微生物進行檢驗，并且進行統計。第二，食品微生物檢驗人員要對微生物進行定期檢查，避免食品中出現工業微生物。第三，對可導致人類中毒的微生物進行檢驗。第四，檢驗人員對可使食品出現腐敗現象的微生物進行檢驗。總之，食品微生物檢驗人員在執行工作期間，接觸的微生物種類非常多，因此，相關檢驗人員必須對其加以重視，保證采集出有利于提高食品安全性的檢驗樣品。此外，在食品微生物檢驗時，檢驗人員要注意到食品中微生物檢驗與醫學微生物檢驗的區別，這體現出食品檢驗工作具有快速性的特點。

由于食品中所含的微生物較多，對其產生影響的因素也有很多，為能提高其檢驗質量，必須要對以下幾點工作加以重視。

1.檢驗人員的專業素質

在食品微生物檢驗期間，要提高檢驗人員的工作質量，就不能單一地憑借檢驗儀器執行工作，由于整個食品微生物檢驗過程中，都需檢驗人員具有良好的分析能力與判斷能力，所以食品微生物檢驗人員要掌握一定的技術原理，并嚴肅對待檢驗工作，保證提高工作質量。同時，食品微生物檢驗企業還要為工作人員提供定期的培訓機會，對檢驗人員進行專業知識培訓，使其掌握先進的檢驗知識與檢驗技術。此外，國家還要推行食品微生物檢驗法律法規，要求檢驗人員在考取資格證書后才能上崗工作。

2.食品微生物檢驗環境

食品微生物檢驗工作是在專門的實驗室中進行的，不僅可避免出現污染現象，還能防止出現檢驗人員感染病原菌的問題。因此，食品微生物檢驗部門要對檢驗環境加以重視。首先，要科學、合理地對實驗室進行布局，選擇污染程度低的區域，并保證不會對檢驗人員的安全造成威脅，如操作區域與辦公區域要相互分離。其次，要對檢驗環境進行清潔與消毒，檢驗工作產生的廢棄物要統一處理，避免出現病原菌散布現象。

3.食品微生物的采樣工作

食品微生物檢驗中的采樣工作是最為重要的，相關檢驗人員必須對以下幾點加以重視。首先，檢驗人員要重視采樣工具與容器的選擇，應選擇耐消毒滅菌的材料，使其更好地應用于食品微生物檢驗作中，進而提高檢驗效率。其次，在食品微生物檢驗工作實施前，相關檢驗人員要對檢驗工具與容器進行清洗滅菌，在滅菌處理后，要存儲在干燥的地方，避免造成不利影響。最后，在每件檢驗樣品封口后，食品微生物檢驗人員要在樣品上貼標簽，并做好記錄，采樣的樣品不可少于需要樣品數量的3倍，從而提高其檢驗效率。

4.食品微生物檢驗報告

食品微生物檢驗人員要重視檢驗報告，根據國家相關標準進行準確的檢驗評估，在評估后，為保證檢驗報告質量，相關檢驗人員還要對檢驗報告進行復查，為報告質量的提高提供有力支持。

食品微生物檢驗人員在進行檢驗工作的過程中，必須對檢驗質量加以重視，保證創新自身檢驗方式，開發新型檢驗技術，使檢驗質量向著更好的方向發展。