1、緩慢移動原則：為了避免影響正常的風路狀態，操作時手應該盡量平緩移動。

2、物品平行擺放原則：為了避免物品和物品之間的交叉污染現象產生，在柜內擺放的物品應該盡量呈橫向一字擺開，避免回風過程中造成交叉污染。同時避免堵塞背部回風隔柵影響正常風路。

3、避免震動原則：柜內盡量避免震動儀器(例如離心機、旋渦振蕩器等)的使用，因為震動會使得積留在濾膜上的顆粒物質抖落，導致操作室內部潔凈度降低，同時如果在操作過程中設備失衡還會引起實驗污染甚至感染操作者。

4、不同樣品柜內移動原則：柜內兩種及以上物品需要移動時，一定遵循低污染性物品向高污染性物品移動原則，避免污染性高的物品在移動過程中產生對柜體內部的大面積污染。

5、明火使用原則：柜內盡量不要使用明火。因為在明火使用過程中產生的細小顆粒雜質將被帶入濾膜區域，這些高溫雜質會損傷濾膜。無法避免一定需要使用的時候，宜使用低火苗燈。

1、操作之前，針對本次操作所需的全部物品移入到安全柜中，避免雙臂頻繁穿過破壞氣流，并且在移入前使用消毒劑進行表面擦拭，用來消除污染。

2、打開風機三十分鐘時間，等到生物安全柜氣流穩定之后，再次進行操作，將雙臂緩緩的伸入到安全柜中，至少要靜止一分鐘時間，幫助生物安全柜穩定之后在進行操作。

3、生物安全柜內不放置與實驗無關的物品，安全柜擺放在潔凈區域，半污染區域和污染區域進行基本的區分。操作過程中，物品應該盡量前后放置，避免擋住氣道口，以免干擾到正常的空氣氣流。