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而大部分通報信息中的不合格食品都涉及“檢出微生物污染”。食品的微生物污染是指食品被微生物及其毒素污染。由于微生物具有較強的生態適應性，在食品原料種植、收獲、飼養、捕撈、加工、包裝、運輸、銷售、保存以及食用等每一個環節都可能被微生物污染，威脅食品安全和人類健康。
食品微生物4大檢測指標
微生物檢測設備
18. 干熱滅菌箱 滅菌設備
所以食品微生物檢測是食品安全檢測不可或缺的一環。
食品微生物檢測通常包括以下4個指標：菌落總數、大腸菌群、致病微生物、霉菌與酵母菌數。
菌落總數是指示性微生物，并非致病菌，主要用來評價食品清潔度，反映食品在生產過程中是否符合衛生要求。菌落總數超標可能由于原料、包材或生產加工過程受微生物污染，生產加工過程中手工操作較多，人員、設備和環境的清洗消毒不到位，有滅菌工藝的產品滅菌不徹底等原因造成。食品菌落總數可以反映該食品被污染的程度、食品耐放程度以及食品腐敗狀況。
大腸菌群是通用的食品污染常用指示菌之一。食品中檢出大腸菌群，提示被致病菌(如沙門氏菌、志賀氏菌、致病性大腸桿菌)污染的可能性較大。大腸菌群超標可能由于產品的加工原料、包裝材料受污染，或在生產過程中產品受人員、工器具等生產設備、環境的污染、有滅菌工藝的產品滅菌不徹底而導致。大腸菌群可以作為糞便污染食品和腸道致病菌污染食品的指示君。
致病性微生物。食品生產時一個時間長、環節多的復雜過程。與食品有直接或間接關系的致病性微生物都有可能污染食品。能引起人類疾病和食物中毒的致病性微生物如沙門氏菌、葡萄球菌、鏈球菌、副溶血性弧菌、口蹄疫病毒等，能產生毒素并引起食物中毒的微生物如肉毒梭菌、葡萄球菌和產氣莢膜桿菌，和某些真菌等。
菌與酵母菌數也作為評價食品安全衛生質量指示菌，并以霉菌和酵母菌數作為判定食品被霉菌和酵母菌污染程度的標志。霉菌污染可使食品腐敗變質，破壞食品的色、香、味，失去食品的食用價值，并產生真菌毒素危害人類健康。霉菌超標的原因，可能是原料或包裝材料受到霉菌污染;或者產品在生產加工過程中衛生條件控制不到位，生產工器具等設備設施清洗消毒不到位;或者產品儲運條件不當而導致。
說到微生物檢測指標，那一定離不開檢測設備。那這些檢測利器有哪些呢?小編匯總了常規微生物實驗室微生物檢測所需的25款儀器設備，快看看你們實驗室是否集齊了呢?
1. 自動菌落成像分析系統 用于菌種計數
2. 全自動微生物鑒定儀
主要可鑒定的菌屬：腸桿菌、非發酵G(-)桿菌、葡萄球菌、酵母菌、厭氧菌等
3. 便攜式細菌快速檢測儀
快速檢測細菌總數、霉菌、酵母菌
4. PCR儀 定量核酸檢測及分子診斷
5. 熒光酶標儀 微生物血清學鑒定
6. 熒光定量PCR儀 核酸定量
7. 冷凍臺式高速離心機 用于離心、加速沉淀等前處理
8. 凍干機 保存樣品
9. 超低溫冰箱 保存樣品
10. 低溫冰箱 保存樣品
11. 超凈工作臺 空氣凈化作用的設備
12. 生物安全柜 保護工作人員健康\樣品\環境安全
13. 生化培養箱 微生物培養
14. 霉菌培養箱 霉菌培養
15. 熒光顯微鏡 微生物檢驗
16. 生物顯微鏡 微生物檢驗
17. 高壓蒸汽滅菌器 滅菌設備
19. 電熱恒溫水浴鍋 精密恒溫、輔助加熱
20. 均質器 微生物學檢測的樣品制備
21. 全自動微生物平皿螺旋加樣系統 用于經均質和/或稀釋好的樣品進行培養皿螺旋式接種
22. 精密電子稀釋儀 樣品稀釋
23. 數字式液體稀釋儀 樣品稀釋
24. 細胞染色儀 細胞染色
25. 空氣采樣儀 空氣采樣
