微球表面的官能基團在一定環境中能夠與待檢測物質發生反應，吸附待檢測物。有機物肼是一種有毒物質，但它在工、農業生產中大量應用。Yang等通過共聚苯乙烯與1-戊烯二酮制備了一種表面帶有羰基的磁性微球，它能與肼反應生成電活性物質，通過對電活性物質的伏安法檢測就能得知廢水中的微量肼的含量。

        此外，磁性微球還可以作為絮凝劑來凈化廢水，用的較多的是殼聚糖磁性微球。殼聚糖的胺基極易形成四級胺正離子，可以和弱堿性陰離子交換。殼聚糖類在酸性溶液中易于溶解，不穩定，同時它在酸性環境下類似陽離子型聚電介質，可作為凝聚劑，因此將殼聚糖制成磁性微球可以提高它的應用價值。朱開梅等用反相懸浮聚合制備了殼聚糖的磁性復合微球，該微球單分散性好，粒徑分布較窄。作者進一步探索該微球對造紙廢水處理的效果，實驗發現經微球處理后，廢水中的化學需氧量（COD）去除率達到85%，證明該殼聚糖磁性微球在廢水處理中是可行的。洪愛真等同樣制備了殼聚糖的磁性微球，將它用在酸性偶氮染料的脫色中，在pH為2-6的操作條件下，該微球對酸性染料有優良的脫色能力，并且可以再生回收，重復使用。Yauvz等采用溶劑揮發法制備了以PSt為殼層的磁性復合微球，微球粒徑范圍在0.5-0.595mm之間，并將該微球用在生物流化床反應器中進行廢水中有機物降解，結果證明磁性微球在流化床中處于流化狀態，微球表面生物掛膜效果比較好，能夠進行微生物的降解。經過30-35h后，形成的生物膜仍能夠保持高活性。