法則1：學習你所在機構或實驗室的筆記本方案

實驗室筆記本對于良好的記錄保存、研究管理、保護知識產權和防止欺詐來說是非常重要的工具。對于先進的研究機構、公司的研發部或者大學的研究實驗室來說，完整規則的實驗室筆記本策略應該要被落實。在缺乏一個制度政策的情況下，你的研究小組應該有一個統一的方案來規劃所有研究成員日常記錄的進程，例如：實驗室的使用及維護情況。如果您的機構或實驗室沒有一個標準的方案，那么以下的一些法則是給你為保持記錄科研活動提供一些指導，可能這些記錄對你、你的主管或者你的同行都非常重要。

法則2：為你的實驗室筆記選擇合適的媒介

這里有三種實驗室筆記本類型：裝訂或縫合的筆記本，單頁或活頁筆記本以及基于計算機的電子筆記本。每種筆記本都有各自的優點和缺點。而你需要為你的研究去選擇合適的筆記本類型。大多數的計算生物學家會在同一時間處理多個項目。如果你覺得只利用一個實驗室筆記本來記錄實在是太復雜，那么你可以用多個筆記本分別記錄不同的項目。另外，你也可以使用活頁筆記本（將不同的項目名稱寫在標簽上然后貼在筆記本上，每個項目的內容則在標簽后一頁開始記錄，以此分別記錄各項目）。您還可以選擇使用電子筆記本，它的優點是容易搜索并且計算機生成的數字可以被迅速復制到筆記本中。如果你不能識別合適的編輯方法，那么制作一個完美的電子筆記本是非常費時的。有些實驗室使用Microsoft Word來編寫實驗室筆記本并保存為“網頁”形式，然后將條目自動保存至WordPress.com。微軟的OneNote是一個專有的軟件選項。如果你寫了大量的計算機代碼以及收集了大量的數據，那么電子筆記本對你來說是更好的選擇，因為你可以存儲并鏈接你的代碼和數據到你的電子實驗室記錄中。電子實驗室筆記本可以在不同的電腦中共享，也可以將其與同事在線交流。但是如果你還沒有合適的技術用于電子實驗室筆記本的保存，那么你可以先將計算機代碼和數據保存在一個安全的介質中（如硬盤，CD-ROM，云存儲，數據庫，紙質副本等），另外再將易于識別的代碼或數據記錄在你的紙質筆記本中。

法則3：養成在桌上放一本實驗室筆記本的習慣

你需要隨時拿著你的實驗室筆記本，并且在工作中及時書寫記錄。如果你依靠回憶來記住會議上的好主意、建議或利用回憶數據來分析及模擬模型中的重要步驟，那么你會發現自己在某些情況下是不會擁有批判性思維的。此外，通過做筆記你將發現寫作可以為這些想法提供思考的機會，以此通過邏輯來論證猜想、結果或結論即筆記有助于實現科研中的批判性思維。

法則4：在你的實驗室筆記本中記下所有的科研活動

有很多科學家相信實驗室筆記本中對應的干性或濕性實驗操作條目的記錄應該是有限的。然而，一個理論科學家的智力活動不應該被實驗來限制假設。當你思考可能的研究方向和理論是如何作用于系統的時候往往能產生一些突破性的科學想法。如果你使用紙墊或其他紙來寫下你的想法或會議和研討會的筆記，之后你可能會遺失這些重要的想法或浪費太多的時間去尋找這些想法。所以，在筆記本中記錄你所有的科學活動將解決這個問題。科學家應該記錄每一次實驗、每一個研究結果、每一次研究會議，并保留研討會的筆記、研究會議的電話以及與他們研究所相關的問題，所有的這些項目都要寫入實驗室筆記本中。在一個非常真實的方式中，實驗室筆記本是每一項學術活動按時間順序記錄的日志。當科研活動或者工作結束后，你應該立刻在實驗室筆記本上寫下所有的條目。

法則5：每一各項目都應該連同日期、主題和方式一起被記錄

實驗室筆記本最合乎邏輯的組織是按時間順序排列的。每一個項目都應該包含它的日期和主題。如果你在同一天內進行了不同的工作項目，那么在筆記本上你應該使用標題區分，并在各項目之間留下足夠的空間。工作項目的標題是非常重要的，他們應該是簡短的、尖銳的并且富含信息的，因為你會利用它們來建立實驗室筆記本的目錄。如果你使用的是紙質的筆記本，你需要寫上日期和工作時間點以此使項目記錄更為清晰；另外，你也可以使用永久性墨水及實驗室每個人都能理解的通俗語言來記錄。如果你使用的是電子類筆記本，那么每個項目的日期和時間點將自動保存在每個主題下。

法則6：記錄每一個結果產生的過程

科學的黃金標準是可重復性。你需要記錄你的每一個實驗結果是怎樣產生的，是通過計算機實驗、數理統計還是數學模型。應注意實驗操作步驟的順序對于實驗結果和分析是不是可以復制重現。在你的模型、分析或實驗中，每一個步驟你都應該記錄其細節及影響。這包括干性或濕性實驗、預處理過程、中間步驟、分析與后處理結果。你應該存儲所有的原始數據。這將為實驗結果的可視化提供確切的數值。

法則9：為你的實驗室筆記本創建目錄

當你完成一個項目或者完成一天的工作時，你應該將已完成的項目標題在實驗室筆記本的目錄中標出。類似這樣的索引標志是為了幫助你、你的導師或者其他人迅速有效的查看你的工作。目錄的形式是多種多樣的。你應該使用在所在實驗室規定的格式。一般來說，每一個記錄在目錄表中的項目都應標明起始日期、主題以及筆記本中對應的頁碼。為了在實驗室筆記本中快速找到所需信息，你應該將每一個項目的開篇記錄在新的頁面上。然后，編輯標簽和日期。當你做到這一點，你便可以開始做筆記并盡可能多的記錄你需要的內容。如果你采用標準的紙質筆記本，其頁面是已經有編號的。現在你將進行最為關鍵的一步：在你筆記本的第一頁上創建一個目錄并編輯你將記錄的科研事件及頁碼。如果你沒有標準的實驗室筆記本，你自己可以在每一頁頂端編輯頁碼。另外，使用電子實驗室筆記本的一個優點是你無需擔心如何創建一個目錄，因為電子筆記本會在你完成輸入時自動保存。

法則7：保護你的實驗室筆記本

紙質的實驗室筆記本是不應該被任何人帶回家的。當你每天離開實驗室的時候，你應該將你的筆記本放在能夠找到的地方。最好是你每天都把它鎖在同一個地方。如果你的研究機構或實驗室主管允許，那么你將有權復印你的實驗室筆記本，但是筆記本的原始版本還是屬于支付你工資和處理你研究項目的機構的。