志賀氏菌屬的細菌對甘露醇分解能力不同，可分為二大組。

　　A、不分解甘露醇組：主要為志賀氏菌。又根據能否產生靛基質，進一步分靛基質陽性（1、3、4、5、6、9、10型）和靛基質陰性（2、7、8型）的志賀氏痢疾菌。

　　B、分解甘露醇組：包括福氏、鮑氏、宋內氏菌。再按乳糖分解情況，分為遲緩分解乳糖的宋內氏和不分解乳糖的福氏和鮑氏菌。后者進一步再根據靛基質產生與否，分靛基質陽性（福氏菌1、2、3、4、5型和鮑氏菌5、7、9、11、13、15型）和靛基質陰性（福氏菌6型和鮑氏菌1、2、3、4、6、8、10、12、14）二類。