綠色食品標準以全程質量控制為核心，由以下六個部分構成：
　　1.綠色食品產地的環境標準，即《綠色食品產地環境質量標準》。
　　2.綠色食品生產技術標準。
　　3.綠色食品產品標準，該標準是衡量綠色食品最終產品質量的指標尺度。
　　它雖然跟普通食品的國家標準一樣，規定了食品的外觀品質、營養品質和衛生品質等內容。但其衛生品質要求高于國家一行標準，主要表現在對農藥殘留和重金屬的檢測項目種類多、指標嚴。反映了綠色食品生產、管理和質量控制的先進水平，突出了綠色食品產品無污染、安全的衛生品質。
　　具體體現在以下幾個方面：
　　（1）原料要求：綠色食品的主要原料必須是來自綠色食品產地，按綠色食品生產操作堆積生產出來的產品。對于某些進口原料，例如果蔬脆片所用的棕櫚油，生產冰淇淋所用的黃油和奶粉，無法進行原料產地環境檢測的，要經中國綠色食品發展中心指定的食品監測中心，按綠色食品校舍是行檢測，符合標準的產品才能作為綠色食品加工原料。
　　（2）感官要求：有定性、半質量、定量指標。其要求嚴于同類非綠色食品。例如，國家《大豆油標準》（G1535-86）中以及《食用植物油衛生標準》（GB2716-88）中，均無“透明度”這項感官指標，而《綠色食品大豆油標準》（NY/T286-95）增加了“透明度”批標。又如食品全脂乳粉感官評分標準均達到國際GB5410的特級。
　　（3）理化要求：蛋白質、脂肪、糖類、維生素等指標不低于國標要求，農殘和重金屬等污染指標懷國外先進標準或國際標準接軌。
　　（4）微生物學要求：產品的微生物學特性必須保證，如活性酵母、乳酸菌等。而菌落總數，大腸菌群、致病菌、糞便大腸桿菌、霉菌等微生物污染指標嚴于國際。
　　4.綠色食品包裝和標簽標準。
　　5.綠色食品貯藏、運輸標準。
　　6.其它相關標準包括《綠色食品推薦肥料標準》、《綠色食品推薦農藥標準》、《綠色食呂推薦食品添加劑標準》和《綠色食品生產基地標準》等等。此項標準不是綠色食品質量控制必需標準，而是一項中進質量控制管理工作的輔助性標準。以上標準對綠色食品產前、前中、產后全程質量控制技術和指標作了明確規定，既保證了綠色食品無污染、安全、優質、營養的品質，又保護了產地環境和合理利用資源，以實現綠色食品的可持續生產，從而構成了一個完整的、科學的標準體系。