常溫貯藏蒜薹，保質期只有10～15天。利用0℃的低溫，可以貯藏兩個月。如果低溫加氣調（氧氣2%～4%，二氧化碳6%～8%），則5～6月收獲的蒜薹，可貯藏到元旦甚至春節。
    貯藏前要用漂白粉200倍液或其他通用殺菌劑噴灑貯藏庫的墻壁、浸洗用具。也可在甲醛中加入高錳酸鉀，關閉庫門密封熏蒸24小時，再打開通風。消毒后庫房連續開機保持0℃。
    白皮大蒜品種、沙壤中生產的蒜薹最耐藏。當薹長出頂生葉并向一旁彎曲（也稱打鉤）繞一圈時為適宜采收期。

    有三種貯藏方式可供選擇：

    1.普通塑料袋貯藏

    蒜薹收獲后要盡快在0℃下預冷，邊預冷邊整理，將蒜薹按0.5～1kg捆成1把，裝入60cm×100cm的聚乙烯（厚度0.06～0.08mm）包裝袋內，每袋15kg。裝袋時薹梢一律朝向袋口，嚴禁頭尾混裝。等蒜薹的溫度降到0±0.5℃時扎口。嚴格控制庫內溫度在0±0.5℃，相對濕度80%～90%。為防止袋內二氧化碳濃度過高，貯藏期間須定期通風。一般貯藏前期（入貯至9月），每10～15天通風1次，時間4小時；中期（10～12月）每8～12天通風1次，時間8小時；后期（12月以后）每8天通風1次，時間24小時。在包裝袋通風前后，庫房要徹底通風。保持袋內氧不低于2%，二氧化碳不高于10%。蒜薹距冷風機要在1m以外，以防受凍。為防止薹梢霉腐，可在入庫后或8月上旬用250倍多菌靈噴梢。

    2.硅窗袋氣調法

    用厚0.06～0.08mm的聚乙烯薄膜制成60cm×100cm或70cm×100cm的包裝袋。其上分別鑲嵌FC-8布基硅橡膠膜（即硅窗）70～80平方厘米或96～110平方厘米，裝量分別為15kg和20kg。將蒜薹入庫、預冷、整理、捆把、裝袋、扎口，方法及注意事項同塑料袋小包裝法。扎口前在袋內放入克霉靈，可防薹梢發霉，5kg蒜薹用1ml克霉靈。控制庫內溫度在0±0.5℃，相對濕度80%～90%。用硅窗袋貯藏能自動調節袋中的氣體成分，不須開袋放風。

    3.薄膜大帳貯藏

    先在地面上鋪0.02mm厚的薄膜，再在上面擺菜架，架上放蒜薹，每層高20～30cm。等溫度穩定在0℃時，套上厚度0.02mm的薄膜帳。帳的大小因貯藏量而定，帳的周邊與地面所鋪薄膜重疊，卷好，壓緊，密封。定期測定帳中的氧和二氧化碳濃度。當氧的濃度降到2%時，打開大帳兩頭預先做好的筒形袖口，通入空氣。用抽氣機可加快通風換氣。如果二氧化碳高于8%，可通過袖口放入生石灰包，吸除過多的二氧化碳。