菠菜屬于耐寒性綠葉菜類，其耐寒性很強。在我國北方地區冬季多采用凍藏和冷藏等方式進行貯藏，以調劑和滿足市場的需求。
    菠菜的栽培品種有圓葉型和尖葉型兩種類型。應選擇葉厚、色深的尖葉型類型或尖、圓葉型的雜交種進行貯藏。這類品種耐寒性強，適合于貯藏。菠菜的適宜貯藏溫度為0℃，也可在-4～-2℃下凍藏。適宜相對濕度為95%～100％。
    用于貯藏的菠菜在栽培中應避免過量施用氮肥，采收前 1周盡量不要灌溉，以免菠菜軟弱徒長，不耐貯藏。采收時間要選在早晚，避開正午。采收后立即進行預冷。菠菜是預冷效益最大的蔬菜之一，即預冷容易(時間短、耗電少)、效果大(比不進行預冷的菠菜新鮮，且貯藏期也大為延長)。真空預冷時20分鐘左右即可將溫度降至5℃左右。
1．凍藏
    在風障或房屋等的遮陰處(北側)，挖幾條平行的貯藏溝，溝寬35厘米，溝深20～30厘米。溝與溝之間隔20厘米左右。將菠菜以散狀或小捆狀直立碼在溝內。溝內放滿菜后，薄薄蓋一層沙土。隨氣溫下降增加覆土的厚度，使溝內溫度不低于-8℃。
    當溝寬為1米以上時，溝底要挖2～3條通風道。通風道的深、寬各約15厘米，兩端通向地面作為通風口。通風溝上面(貯藏溝底部)鋪一層秫秸，秫秸上碼菠萊。
    凍貯之后的菠菜要在0℃左右的條件下，花3～4天來解凍。如果解凍溫度過高，菠菜會變得軟爛，不能恢復新鮮狀態。    2．塑料薄膜包裝
    預冷后的菠菜裝入厚0.08～0.1毫米，長110厘米，寬80厘米的聚乙烯袋中，平放在架子上，敞口一晝夜，次日松扎袋口。庫溫需維持在±0.5℃。貯藏初期1個月檢查一次質量，以后每隔15天檢查一次。據報道，采用此法春菠菜可貯藏30天左右，秋菠菜可貯藏80天左右。