（1）普通凍藏法 需要進行冷藏的菠菜一般是夜晚地面上凍，中午又能化凍時采收。采收時帶約1.6cm長的根，抖凈泥土，整理捆把，每捆2Kg左右， 放在陰涼處晾掉露水，并使菜體發涼，待天氣轉冷時凍藏。貯藏場地應選在遮陰處，整平地面，挖寬深各3.5cm的若干條溝，溝間距10cm～10cm， 將菠菜根朝下擺放入溝，總厚度為25cm左右。 到嚴寒季節可在上面再加蓋草苫子等，保持溝內溫度為－8℃～－5℃。
　　
（2）通風溝凍藏法 為克服普通凍藏法不能調節溫度的缺陷，可采用通風溝凍藏法。溝寬1.5m，深0.5m，順溝底挖2條寬25cm左右的通風道， 通風道兩頭相通，通風用架桿橫鋪一層， 將菠菜捆擺在架桿上，覆土與普通凍藏相同。 天暖時利用通風道交換外界冷空氣，天氣轉冷后用草把堵塞通風道，開春天氣轉暖后再逐漸打開。
　　
（3）暖貯藏法 挖寬75cm、 深60cm的溝，立冬至小雪間起菜，隨即將菠菜根朝下擺放溝內， 蓋上一層甘蘭葉，溝頂蓋草苫。之后隨天氣變冷蓋草苫， 使溝內保持0℃～2℃

（4）地上凍藏法 在收獲前5d～6d， 把菠菜場地整平，潑一層水，以保證表土不解凍為宜。 貯菜時，先撒些菜葉或樹葉鋪底， 然后把菠菜一捆挨一捆地擺在上面，再在菜的四周用菜葉或樹葉蓋好， 約有10cm～10cm即可。當菠菜內部凍結時， 再在上面蓋10cm厚半干濕的沙子，以防葉子失水過多，造成損失。
　　
（5）合畦凍藏法 選好菠菜生長健壯的地塊及合畦凍藏組合，每個組合三畦， 其中左一畦和右一畦為起菜畦，中間一畦為凍藏畦。凍藏前， 先用鐵锨把凍藏畦菠菜全鏟斷根系，其深度以入土1.5cm為宜， 全鏟時不要弄亂菜株。同種方法，把左右兩畦的菠菜鏟起， 扣蓋在中間的凍藏畦上，葉部朝下，根部向上， 3個畦子的菠菜合成1畦，貯藏當天，將合畦表面用土埋嚴， 輕拍，使菠菜上下層之間密合，防止寒風進入，氣溫過低時，再蓋一層7cm～10cm厚的細土， 利用此法可貯到翌年春分。
　　
（6）氣調冷藏法 菜入庫前每立方米用15g硫磺點燃熏蒸庫房，封閉24小時～26小時消毒， 放煙后將庫溫降至－2℃左右。將帶2cm長根， 一斤一捆的菠菜分層擺在架上， 在菜溫與庫溫達到平衡時裝入規格為100cm×80cm的塑料袋中，并扎緊袋口。 一般每袋裝10Kg～13Kg， 庫內溫度控制在－1℃～0℃，濕度控制在95％， 如袋內有水則應加生石灰吸潮。封袋后靠自然降氧。 當袋內二氧化碳分壓達到6％時開袋放風，給全氧，使氧分壓達到18％～21％，然后再封閉， 一周后袋內二氧化碳又升至5％～6％，再開袋放風。這樣反復進行直到貯存結束。