畜禽產品加工要建立有效的管理制度，如原料、成品管理制度、生產記錄制度等；采購人員應掌握原料鑒別技能，技術人員要掌握加工專業知識；設立檢驗科室，質檢人員要達到一定學歷，要配備相應的儀器設備；應設置質量安全管理機構；當地動物衛生監督機構應負責動物檢疫。

投入品控制

原料要來自無公害農產品產地。需要注意的是：活畜禽經駐場檢疫人員檢驗提供合格證明后方可入廠屠宰，豬、牛、羊等動物應停止喂食，但可供水（宰前停供水）；廠區除待宰動物外，不可飼養其他動物；原料乳各項指標要符合《無公害食品生鮮牛乳》（NY5045）的規定，須凈化脫除雜質；嚴格去除破蛋、劣蛋、臭蛋等。食鹽、茶葉、生石灰等加工原料應符合衛生要求，加工用水符合《無公害食品畜禽產品加工用水水質》（NY5028-2001）要求。

原料存放要分批次，合格、待檢、不合格原料藥分離存放。藥品要有專人保管，貯存于專門的庫房、藥品柜內；消毒劑、殺蟲劑、清洗劑等藥品需有明顯標志；經過培訓的人員才可以使用藥品，不能在生產車間使用、存放任何可能污染食品的藥劑。

生產加工

加工工藝流程布局合理、科學，無交叉相遇，需制定技術規程和操作規范。投料前除嚴格檢查原料外，還要檢查生產場所、設備，設備要定期維修，灌裝、裝填使用自動機械設備；對產品實行嚴格的質量控制，整個過程都要有生產記錄。

產品包裝后貼好標簽，并附產品說明書。產品出廠前應貯存在有較好環境的成品庫里，如鮮肉冷藏庫要一般為0~4℃，冷凍庫溫度一般在-18℃以下，高溫殺菌乳常溫避光貯存，巴氏殺菌乳貯存溫度為2~6℃。出廠前對產品按出廠檢驗項目指標逐批檢驗。

衛生消毒

制定有效的衛生管理、消毒制度，由專人負責實施；有相應的設施，如消毒池、洗手池、沐浴室等；生產設備、工具、容器、場地使用前后要清洗、消毒；從業人員要有健康證，進入車間穿戴工作服、帽、鞋，頭發不露帽外，工作服蓋住外衣，還需經過相應的技術培訓；消毒操作規范。

檢驗檢疫

產品的檢疫工作均由動物衛生監督機構實施。屠宰車間應設有供檢疫人員操作的場地、設施，對可疑病變肉，送實驗室檢驗，檢驗合格后，方可貼檢疫合格標志；企業要有檢驗室和化驗室，對器材、設備、儀器定期檢查或檢定，按照無公害農產品標準組織生產。