抗菌獸藥在使用時，要選擇好所用的劑量和適宜的療程。一般開始治療時可選用較大劑量,待血藥濃度達到較高程度后,再根據病情酌減劑量。藥物的療程可視疾病類型和患畜病況而定。急性感染的病例其療程不宜過長,在感染控制后3天左右停藥。對于一些慢性感染的病癥則應適當延長療程,以鞏固其療效。否則盲目加大劑量會造成藥物和經濟上的損失,還可使患畜產生不良反應。若用量不足或療程過短,則起不到治療作用,使細菌產生耐藥性。

聯合用藥要避免發生拮抗

聯合用藥如果選擇得好,即可獲得協同和累加作用,以提高其療效,減少抗菌藥物用量,減小毒性反應；如果選擇得不好,則可能出現拮抗作用。所以聯合應用抗菌藥應選擇最佳的藥物聯合。一般情況下兩種抗菌藥聯合應用,特殊情況下選3種或3種以上的藥物聯合應用。但在聯合用藥時應注意可能出現的配伍禁忌。

在輸液中,有些藥物混合后常出現渾濁、變色、沉淀及降低抗菌活性。如青霉素G不宜與四環素類、氨基甙類、多粘菌素E、兩性霉素B、磺胺藥鈉鹽及碳酸氫鈉、氨基酸、維生素C、去甲腎上腺素、氯丙嗪等聯合靜脈注射。

四環素類與多種藥物都有配伍禁忌,適宜單獨靜脈注射給藥,不宜與含鐵、鈣、鋁、鎂、錫等藥物或飼料同服,因可形成不易溶解的復合體而影響吸收；也不宜與碳酸氫鈉同服,因后者可使pH值升高而降低其溶解度。

兩種藥物合用時,可引起毒性加劇。如氨基甙類與頭孢菌素類合用,可引起急性腎小管壞死。

明確臨床癥狀避免濫用藥

根據臨床診斷、患畜全身狀況及感染的輕重選擇合適的抗菌藥。

診斷為病毒病或已被病毒感染的不宜應用,因為一般抗菌藥,特別是抗生素都無抗病毒作用。

患畜發熱原因不明不宜應用,因使用后可使病原微生物不易被檢出,由于臨床表現不典型而影響正確診斷或延誤及時治療。

盡量避免皮膚、黏膜等局部應用,防止發生過敏反應或引起耐藥菌產生。