免疫是控制家畜傳染病的手段，幾乎所有畜群都需進行免疫接種。然而有些畜群經免疫接種后卻不能抵御相應疫病的流行，舊病常發，新病迭出，造成免疫失敗。導致這一現象的原因是多方面的，在實際工作中應全面考慮。
　　母源抗體的影響
　　由于各種疫苗在種畜中的廣泛使用，可能使種畜的母源抗體水平提高，若接種過早，當疫苗病毒注入幼畜體內時，會被母源抗體中和，從而影響疫苗免疫力的產生。
　　疫苗的質量
　　疫苗保存不當或疫苗過期。
　　疫苗選擇不當
　　有的疫苗有幾個不同的品系，不同的品系毒力不同，若首免時選用獨立較強的品系，不但起不到免疫保護作用，而且接種后還會引起發病，導致免疫失敗。
　　疫苗使用不當
　　稀釋劑選擇不當：多數疫苗稀釋時可用生理鹽水或蒸餾水，個別疫苗需用專用稀釋劑。若需用專用稀釋劑的疫苗用生理鹽水或蒸餾水稀釋，則疫苗的效價就會降低，甚至完全失效。
　　用活疫苗免疫的同時使用抗生素類藥物會影響免疫力的產生：表現為用疫苗的同時引用消毒水；飼料中添加抗生素類藥物；緊急免疫的同時用抗生素藥物進行防治。
　　盲目聯合應用疫苗：主要表現為在同一時間內經不同的途徑接種幾種不同的疫苗。
　　免疫劑量不準：免疫劑量原則上必須按照說明書劑量為準，量不足不能激發肌體的免疫反應，量太多會產生免疫麻痹而使免疫力受到抑制。
　　免疫途徑不當：免疫接種的途徑取決于病原體的性質及侵入途徑。
　　疫苗稀釋后使用的時間過長：從零下幾十度的冰箱中取出的凍干苗應放置一段時間，盡可能縮小與稀釋劑的溫差，以免由于溫度驟升使疫苗中致弱的微生物夭折。疫苗稀釋后要在30分鐘~60分鐘內用完。根據試驗，疫苗稀釋后使用的時間與免疫力產生的保護率存在負相關性，已知多數疫苗稀釋的時間超過3小時再接種，對肌體的保護率為零。
　　免疫接種工作不夠細：例如采用飲水免疫時飲水不足，進行疫苗稀釋時計算錯誤或稀釋不均勻，沒有把應接種的畜只全部接種。
　　早期感染
　　接種時畜群內已潛伏強度病原微生物，或由于接種人員及接種用具消毒不嚴帶入強毒病原微生物。
　　應激及免疫抑制因素的影響
　　饑餓、寒冷、過熱、擁擠等不良因素的刺激，能抑制機體的體液免疫和細胞免疫，從而導致疫苗免疫保護力下降。
　　血清型不同
　　有的病原微生物有多個血清型，如果疫苗的血清與感染的病毒或細菌血清不同，則免疫后起不到保護作用。