1、掛袋消毒法。本方法適用于大面積網箱和網箱群消毒，在預防與病情較輕時使用，大多先用易溶固體藥物，將藥物裝入布袋中，掛在網箱水域讓其慢慢溶化擴散。多點、小量用藥，一般需掛袋3-5天。固體易溶性藥物是根據季節性的預防病況來確定藥物，可多種藥物混合，一般水域性消毒掛袋以生石灰和強氯精為主。

2、涂抹消毒法。本方法可以起撈后逐個進行，將藥液涂抹在龜體上，常用的藥物及濃度為：福爾馬林溶液，濃度為30-40毫克/升；漂白粉溶液，濃度1-2毫克/升；硫酸銅與硫酸亞鐵合劑溶液，濃度為0.5-0.7毫克/升，涂抹時避免藥物流入龜的口腔內。

3、整體藥浴法。本方法可以起撈后整體進行，將龜類撈到配好藥劑的池或缸內，根據龜類的大小與病情，確定用藥的濃度高低及用藥的品種與時間，便于對癥下藥靈活掌握。整體藥浴的龜，沐浴時間嚴格控制在6分鐘以內，讓龜體自然晾干后，及時投入網箱。