對于設施果樹來說，通過根系修剪調節根系生長發育，進而調控地上部生長發育狀況，比直接對地上部采取措施，效果更為直接有效。根系修剪可對樹體產生一系列良性反應：使樹體營養生長消弱、樹體矮化、短枝比例增加，花芽分化多。樹體中氮素營養水平下降，碳素營養水平提高，碳氮比增加，有利于成花。果樹設施栽培中，可較多地利用根系修剪技術，以利于控旺促花，安全越夏。

根系修剪的時間以花期和新梢旺長期為宜，旺樹可修剪兩次，中庸偏旺樹可修剪一次，弱樹不修剪。根系修剪后的效應時間一般持續30~45天，之后恢復根系建造。根系修剪的方法主要有兩大類。

物理修剪法　 利用人工或機械等物理手段將根（尤其是垂直根、粗大根）切斷操作，以達到修剪的目的。可用手工法，即把根系挖出并用剪刀或其它工具將根切斷，也可用特制的機械裝置將根系在一定范圍內切斷。

化學修剪法 　利用一些化學藥品將根致死或抑制其生長，以實現修剪的目的。常用的化學藥物主要是銅離子制劑，如碳酸銅、硫酸銅、環烷酸銅等。這些化學制劑可用于抑制側根，也可用于除去直根。

不論哪種根系修剪法，在具體應用時，應根據樹體年齡、生長發育狀況、生產的目的等因素綜合考慮，靈活掌握，切勿使用過量，導致傷害大，副作用多，達不到應有的效果。