蘋果樹在休眠期病蟲害防治重點有腐爛病、枝干輪紋病、金紋細蛾、葉螨等。此期果園內的害蟲和病原菌停止活動，進入越冬狀態，便于集中消滅。同時休眠期的蘋果樹抗藥性較強，可施用高濃度藥劑進行防治，同時樹上又無葉片，涂抹農藥亦很方便。

農業防治

一是清潔果園。待樹上葉片脫落以后，徹底清掃落葉、病果和雜草，摘除僵果，集中燒毀或深埋，以消滅越冬的病蟲。同時結合冬剪，剪除樹上病枝和蟲枝。二是刮樹皮。山楂葉螨、二斑葉螨、梨小食心蟲、卷葉蛾等害蟲大多在粗皮、翹皮及裂縫處越冬，若能細致周到地刮凈粗皮、翹皮，可殺死50%～90%的越冬害蟲。三是樹干涂白。涂白以兩次為好，第一次在落葉后至封凍前，第二次在早春，主要保護主干、主枝及較大的輔養枝和側枝。

藥劑防治

蘋果樹腐爛病和枝干輪紋病主要在初冬或早春刮除病斑或病瘤后抹藥。刮除腐爛病時，刮治的病斑呈梭形，刮病斑的寬度應比原病斑寬出1厘米左右，深達木質部，將病皮徹底消除。刮治前后所用工具要消毒，刮的病皮帶出果園燒毀。病斑刮除后要用腐必清2～3倍液或2%農抗120的10～20倍液或5%菌毒清30～50倍液涂抹消毒，半月后再用上述藥劑涂抹1次。同時每年早春還要對刮治后3年以內的原病斑用上述藥劑再消毒1次。對蘋果樹腐爛病發生不太嚴重的果園，還可在冬前或早春采用樹體噴藥的方法防治。藥劑可選用：腐必清或2%農抗120或5%菌毒清100倍液；5波美度石硫合劑；5%菌毒清100倍液加腐必清1000倍液。