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生物防治是指利用自然界各種有益的生物本身或其代謝產物進行病蟲害防治的方法。嚴格的生物防治是指利用有益的活體生物本身（如捕食或寄生性昆蟲、螨類、線蟲、微生物等）來防治病蟲害的方法。生物防治作為一種防治植物病蟲害的對策，是農作物病蟲害防治技術中一門傳統應用學科，進入90年代漸漸地融入了現代生物技術的許多內容，成為一項蓬勃發展的綜合技術學科。生物防治是一種持久效應，通過生物間的相互作用來控制病蟲為害，其效果不可能象化學農藥那么快速、有效，但它們的防效是持久的、穩定的。
生物防治是病蟲害綜合防治中的重要方法，在病蟲害防治策略中具有非常重要的地位。煙草病蟲害的生物防治主要包括“害蟲天敵的保護利用、昆蟲信息素與不育性的利用、煙草抗蟲抗病性的誘導和利用、拮抗微生物和害蟲致病微生物的利用、生物農藥的應用”等基本途徑。
保護和利用天敵是煙草害蟲生物防治中的常用手段，包括保護煙田自然天敵、人工大量飼養繁殖和散放天敵、輸引外地有效天敵等方法。通過保護煙田如煙蚜繭蜂、草嶺、瓢蟲、食蚜蠅等自然天敵，使煙田中這些天敵的種群數量能夠維持在較高的水平，可以有效地抑制多種害蟲發生危害。通過人工大量飼養繁殖煙蚜繭蜂、草嶺、赤眼蜂等天敵，在害蟲發生的關鍵時期釋放到煙田中，增加煙田天敵的種群數量、增強天敵對害蟲的自然控制力，控制煙草害蟲的發生和危害。輸引外地的天敵來控制害蟲是生物防治的重要措施，特別是對外來入侵害蟲，通過輸引外地有效天敵進行防治往往是最有效的防治手段。
昆蟲信息素與不育性的利用是生物防治的新手段，包括利用害蟲的性引誘信息素進行誘捕、迷向或交配干擾防治，利用蚜蟲的報警信息素來驅避蚜蟲，利用不育雄蟲進行交配使害蟲后代不育等多種方法。目前，世界上已有多家公司生產多種昆蟲信息素的緩釋劑型、散發器和誘捕器，利用性引誘信息素直接誘殺成蟲或進行交配干擾防治煙青蟲已有較多的應用。
煙草抗蟲抗病性的誘導和利用，包括采用弱致病力菌株對煙草進行保護、利用外源物質誘導煙草的抗病性或抗蟲性增強、利用煙草的抗病抗蟲品種減輕病蟲的危害等方法。如通過接種弱病毒株系保護煙草不受病毒的侵染、栽培K326等品種減輕煙草黑脛病為害等。
應用拮抗微生物、害蟲的致病微生物是煙草病蟲害生物防治的重要手段，包括利用各種有益微生物作為活的屏障用于排斥病害為害或阻止其侵染、抑制病原菌的生長繁殖，利用害蟲的致病微生物造成害蟲形成疾病流行等方法。如利用煙草根際的有益根際細菌防止黑脛病菌的侵入、利用蚜蟲疫霉等造成煙蚜形成疾病流行抑制煙蚜的發生。
生物農藥是目前煙草病蟲害生物防治中運用最廣泛的手段，具有快捷、簡便和易推廣應用等優點，包括應用活體微生物制劑和生物的代謝產物兩大類。目前用于煙草病蟲害防治的生物農藥以代謝產物類居多，如防治赤星病的多抗霉素、防治野火病的農用鏈霉素等等。
生物防治是煙草病蟲害綜合防治中的重要方法，是減少煙田化學農藥的使用、降低煙葉中農藥殘留、保護生態環境、促進煙草農業的可持續發展的重要方法。未來的煙草病蟲害防治，將更加重視以自然因素的生態調控作用，充分發揮生物防治技術在病蟲害治理中的作用，盡可能減少化學農藥的使用，并建立起可持續發展的煙草病蟲害綜合治理體系。
