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西紅柿芽枯病發生部位一般在植株第二、第三穗果的著生處附近。發病株腋芽處出現縱縫，形成裂痕，呈豎“一”字形或“Y”形，裂痕邊緣有時不整齊，但沒有蟲糞，芽枯病發生嚴重的植株，生長點枯死不再向上生長，而是出現多分枝向上長的情況。
防治措施：
1、西紅柿定植后及時噴施新高脂膜可有效防止地上水分不蒸發，苗體水分不蒸騰，隔絕病蟲害，縮短緩苗期，同時注意中午放風，不使棚室內溫度超過35℃；或及時采用遮陽網覆蓋，以降低光照強度，避免造成高溫危害；也可以在高溫的中午，在葉面噴灑清水，以降低周圍溫度。
2、在番茄生長期實行配方施肥技術，并適當增加硼、鋅等微肥的施用，適時中耕除草，合理澆水，噴施促花王3號抑制主梢旺長，促進花芽分化；同時在開花結果期及時噴施菜果壯蒂靈增強花粉受精質量，提高循環坐果率，促進果實發育，防裂果、畸形果發生，使西紅柿品質提高，連連豐產。
3、芽枯病發生后，要注意培養出新的結果果穗，去掉一些徒長枝杈，并噴施新高脂膜形成保護膜，防止病菌侵入；同時在適當的位置留一穗生長較好的花序，用它代替失去的果穗，以減少產量損失，必要時用濃度為0.1%至0.2%的硼砂溶液加新高脂膜800倍液對植株進行葉面噴灑，每隔7至10天一次，連噴2至3次，提高植株抗病能力。
