基肥秋菠菜每畝施有機肥4000~5000公斤，過磷酸鈣25~30公斤，深翻地20~25厘米，宜平畦（北方宜平畦，南方宜高畦）。越冬菠菜選擇土層深厚、土質肥沃、腐殖質含量高、保肥蓄水性能好的土壤，還應比其他季節多施有機肥，每畝可撒施腐熟有機肥5000公斤，過磷酸鈣25~30公斤，深翻地20~25厘米，使土肥充分混勻，疏松土壤，促進幼苗出土和根系發育。

　　追肥秋菠菜幼苗出土后，長到4~5片真葉時，應分期追施2~3次速效性氮肥。每畝順水追施硫酸銨20~25公斤或尿素10~12公斤，促進葉片加厚生長，增加產量，提高品質。越冬菠菜因生育期較長故應分階段施肥，可分冬前、越冬和早春3個階段進行。冬前生長期約50~60天，結合灌水追1次肥，每畝順水施硫酸銨10~15公斤。澆“凍水”時再施入稀糞水1000~1500公斤。越冬停止生長期不需追肥。早春生長期30~40天，當菠菜葉片發綠，心葉開始生長，可澆1次小水。菠菜進入旺盛生長期后，應及時追肥，結合澆水每畝施硫酸銨10~15公斤。此期供給充足的肥水，能延遲抽薹，提高產量，改善品質。