防止施用硝態氮肥  施用硝酸銨、硝酸鉀等硝態氮肥后，容易使蔬菜積累硝酸鹽；也不宜用含氯化肥，氯離子能降低蔬菜的淀粉和糖的含量，使蔬菜品質變壞，產量降低，而且氯離子會殘留在棚室土壤中，能導致土壤酸化，容易造成土壤缺鈣。氯化鉀、硫酸銨等化肥施入土壤后，氨離子、酸根離子不易被作物吸收而殘留在土壤中，會使土壤溶液濃度升高，危害作物正常生長。因此，大棚施肥應選用尿素、磷酸銨、磷酸二銨、過磷酸鈣及專用肥等。

防止在干旱條件下施肥  蔬菜是喜水作物，在土壤干旱時施肥，不但肥效不能充分發揮，而且還會使土壤溶液濃度驟然升高，造成蔬菜燒根。因此，蔬菜施肥時要與灌水相結合，要開溝施肥，把肥料埋嚴實后再灌水，或順水追肥。

防止淺層施肥  大棚由于密閉程度較好，淺層施肥或撒施肥料，極易使肥料揮發，既減少肥效，又易產生氨氣危害。追肥時，應做到穴施或條施，深度為5-6厘米，最好與蔬菜根系保持8-10厘米的距離，這樣可減少蔬菜對硝酸鹽的積累，提高利用率。

防止過量施用未腐熟的有機肥  過量施用豬、牛、羊糞等有機肥，在分解過程中產生的氨氣和亞硝酸氣體會對蔬菜產生危害。如當氨氣濃度超標時，黃瓜和番茄就會受害，最初葉片像被開水燙過一樣，干燥后成褐色；亞硝酸濃度超標時，會使茄子、辣椒等敏感蔬菜受害，嚴重時葉片發白而枯死。大量使用沒有充分腐熟的餅肥，局部容易產生高溫和高濃度的氨及有機酸，容易燒根。

防止施肥過量  大棚追肥要嚴格按照“少量多次”的原則，防止過量施肥。不同土壤每畝1次施用化肥的限量：尿素每畝不超過0.6千克；磷酸二銨沙壤土25千克、黏土和壤土35千克；過磷酸鈣基施沙壤土40千克、壤土和黏土50千克。一旦發現施肥不當，大棚內有害氣體含量過高時，要于中午氣溫較高時打開通風口換氣，降低有害氣體濃度，以保證蔬菜的正常生長。