金針菇在生產完第一潮菇后，培養料中因為缺少水分及營養，菜農在不能及時補足的情況下，常會導致金針菇的產量和質量大幅降低，這樣就需要菇農及時向培養料中補充營養液，以確保金針菇產量和質量的提高。實驗證明，通過給金針菇補充2分錢的營養液，可以多產100多克金針菇，按照每斤金針菇2.0元的價格計算，可以增加0.4元的效益，因此菇農一定要注意為金針菇補充營養。然而現在菇農在種植金針菇時通常分平面栽培及立體栽培兩種方式，這樣菇農在給金針菇培養料補充營養液時方法就應有所區別。

首先，對于平面栽培的金針菇，因為袋口向上，采用這種模式種植金針菇的菇農可以按照菇耳高能源300倍或菇多生200倍的比例溶于水后，直接用水瓢或水壺將營養液倒入料袋內，讓營養液自然滲入培養料中。經過2-3天后檢查營養液是否全部滲入培養料中，對于沒有完全滲入培養料中的營養液，菇農應將其倒掉，并裝入容器中帶出棚外，然后再按照第一潮菇的管理方法進行管理，即可促進金針菇產量的提高。

其次，對于使用立體栽培方式種植的金針菇，因為所有的料袋都橫臥并碼在一起，袋口朝向一側，這樣菇農就必須使用補水針進行補水。菇農可以將配好的菇耳高能源或菇多生營養液裝入水桶中，然后再使用微型水泵加壓，將營養液壓入金針菇培養料中，補充原則按照采多少菇補充多少營養液，切忌將營養液注入過多。如果營養液注入過多，營養液就會從培養料中流出，容易造成病害的傳染。