番茄苗的適宜分苗次數為1～2次，以1次最為普遍。番茄苗不宜進行多次分苗的主要原因是：

⑴減少傷根。因為分苗次數越多，對根系的傷害也就越重，容易造成根系過早老化。

⑵避免形成老化苗。分苗次數過多后，根群始終得不到充分地擴展，吸收能力較弱，將會導致幼苗因營養供應不足而生長受到抑制，當幼苗受抑制的時間過長后，便會形成老化苗。

⑶避免延長育苗期。實踐證明，番茄每分一次苗，由于分苗前的煉苗以及栽苗后的緩苗原因，培育出同樣大小的番茄苗，育苗時間就要相應延長5～8天，在環境條件不適宜時，延長的時間還要長。

⑷減少對番茄苗的其它傷害。如分苗過程中小苗容易受到饑餓傷害。在花芽分化期里進行分苗，會對花芽分化產生不良影響。