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一、蘑菇褐腐病：又名蘑菇疣孢霉病、水泡病、白腐病等。是當前蘑菇栽培中為害最大的病害。除了為害蘑菇外，還可為害平菇、草菇、銀耳、靈芝等。該病在蘑菇不同發(fā)育階段發(fā)生表現(xiàn)癥狀不同，蘑菇開始扭結形成幼小菇蕾時（子實體未分化時）易受侵染，形成硬馬勃狀的不規(guī)則組織塊。上覆1層白色絨毛狀菌絲，以后變暗，最后變?yōu)榘岛稚瑥牟〗M織中滲出暗褐色液滴。覆土下面的小菇蕾也可受感染，在覆土表面出現(xiàn)一些白色菌絲的小斑點。在菌柄和菌蓋分化之后感病，菌柄變成褐色。子實體發(fā)育末期，菌柄基部受感染產生淡褐色變色。發(fā)病嚴重時，第一批菇顆粒無收。
防治方法：1. 改變或破壞發(fā)病的條件，防止病害發(fā)生。疣孢霉孢子不耐高溫，將培養(yǎng)料進行2次發(fā)酵，可殺滅培養(yǎng)料中病原菌的孢子。掌握適當?shù)牟シN期，使出菇期避開高溫的誘發(fā)而致病，菇房的溫度控制在15℃以下。開始發(fā)病時應立即停止噴水，加大通風，使菇床表面干燥，將溫度降至15℃以下。病區(qū)噴1%~2%甲醛溶液或噴50%多菌靈或70%甲基托布津500倍液。2. 覆土消毒。采用巴斯德滅菌法（60℃）處理1小時，或用40%甲醛消毒。3. 換土。發(fā)病嚴重時，去掉原有覆土，更換新土。4、防蟲。做好菇房內菇蚊、菇蠅的防治工作。
二、蘑菇病毒病：該病發(fā)生普遍，為害嚴重。受害程度與感染期有關。一般使用帶有病毒的菌種，則在蘑菇發(fā)育早期發(fā)病，對產量影響極大，甚至絕收。在蘑菇菌絲體生長期由帶有病毒的擔孢子降落在菇床上萌發(fā)而引起發(fā)病的，則第一潮菇生長正常，產量不受影響，隨后的幾潮菇，由于病菇逐批增多，產量逐批下降。子實體最明顯的癥狀是菌柄伸長，菌蓋很小，有的甚至菌蓋直徑不超過菌柄。有的菌蓋薄而平展，早開傘。發(fā)病的蘑菇菌柄上經常出現(xiàn)褐色斑，或條紋狀斑。菇柄內可擠壓出水。
防治方法：1、培育、使用無病毒菌種。2、覆蓋菇床。播種后用地膜或舊報紙覆蓋床面，以防帶毒孢子降落在培養(yǎng)料中，并定期（5~6天）用0.5%甲醛溶液噴灑，直至覆土時為止。3、搞好菇房清潔衛(wèi)生。菇房使用前要徹底消毒。生產結束后，及時清除廢料，床架及用具要浸泡，洗刷曬干，并用1%碳酸鈉加2%五氯酚鈉混合液涂刷，后再用5%甲醛溶液噴灑菇房墻壁、地面及菇床，或用硫磺進行熏蒸。
三、平菇厲眼蕈蚊：屬雙翅目眼蕈蚊科。是為害平菇最普遍最嚴重的1種害蟲。以幼蟲為害平菇的菌絲體和子實體。嚴重時可將菌絲吃光。為害子實體時將菌柄蛀成空洞，將菌褶吃光。
防治方法：1. 搞好環(huán)境衛(wèi)生，減少蟲源。安裝紗門、紗窗，防蟲入內。2. 利用成蟲趨光性，燈光誘殺。3. 嚴重時，于采菇后用1.8%愛福丁乳油2000~2500倍液，或90%敵百蟲1000倍液噴霧。
四、害螨：俗稱菌虱。主要為害蘑菇、草菇、平菇、鳳尾菇、銀耳、黑木耳等多種食用菌。害螨咬斷菌絲使不能萌發(fā)，也能咬嚙小菇蕾及成熟子實體。發(fā)生嚴重時，可將培養(yǎng)料內的菌絲全部食光，造成絕收。
防治方法：1. 把好菌種質量關。保證菌種不帶害螨。2. 使菇房與糧食、飼料、肥料倉庫保持一定距離。3. 培養(yǎng)料2次發(fā)酵。4. 用敵殺死加石灰粉混合后裝在紗袋中，抖散在菇床四周，或用1.8%愛福丁乳油2000倍液噴灑菇床四周。5. 誘殺。將沾有40%~50%敵敵畏的棉團放在菇床下，每隔67~83厘米處放置3團，呈品字形排列，并在菇床培養(yǎng)料上蓋1張塑料薄膜或濕紗布。當螨蟲集滿其上后，取下放在熱水中燙死。
