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品種是大棚番茄種植能否豐收的重要前提，農戶應根據當地土壤和氣候選擇適宜塑料大棚栽培的番茄品種，如在川南地區，大多數土壤粘性重、高溫高濕，因此必須選擇耐濕、抗病（尤其要抗晚疫病）的品種。近幾年比較好的品種有GBS106（大連產）、金鵬1號（西安產）、金牌國粹（西安產）、金光（安徽產）等。不管選擇哪種品種，值得注意的是所選擇的品種除應具成熟早、前期產量高、豐產性好、品質優良、商品性符合市場要求外，還應具有三個特性。
一、耐低溫。在較低溫度條件下，能正常生長開花結果，坐果率高，畸形果、裂果率低。
二、耐弱光。在光照較弱的條件下，能正常生長發育，植株具有葉片較小、葉片厚、光和能力強、株型較緊湊、生長勢強但不旺長的特點。
三、抗病性強。對早、晚疫病、灰霉病、病毒病及葉霉病有較強的抵抗力。
一、耐低溫。在較低溫度條件下，能正常生長開花結果，坐果率高，畸形果、裂果率低。
二、耐弱光。在光照較弱的條件下，能正常生長發育，植株具有葉片較小、葉片厚、光和能力強、株型較緊湊、生長勢強但不旺長的特點。
三、抗病性強。對早、晚疫病、灰霉病、病毒病及葉霉病有較強的抵抗力。
