三唑酮水稻抽穗前，常會有稻瘟病、白葉枯病危害，常用三唑酮（粉銹寧）防治，但使用不當，會導致水稻葉片短小、嚴重時不能抽穗。三唑酮類殺菌劑防治病害的機制是抑制真菌體內單加氧酶的活性，破壞麥角甾醇生物合成，導致細胞膜損傷而死亡。它同樣也能抑制植物體內赤霉素生物合成，使促進細胞伸長的赤霉素不能合成，從而使植物矮化，葉片、果實短小。

烯唑醇在晚稻抽穗初期，常用烯唑醇之類的農藥如12%井·烯唑可濕性粉劑防治稻曲病，藥劑超量，容易出現晚稻抽穗困難，或者穗子抽出一半就會停止的現象。在水稻破口期或破口抽穗初期使用曲紋星、禾果利等含烯唑醇的農藥后，大面積水稻出現不同程度的藥物反應，水稻穗頸節間生長受到影響，出現“包頸”現象，不能正常抽穗。發生藥害后，及早噴施赤霉素有一定的解害作用，一般每畝用2克九二O，加水50公斤噴施。

砷制劑砷制劑在水稻上不當使用會對水稻產生藥害，不結實或結實率下降。目前生產上一般選用三環唑、稻瘟靈、咪鮮胺等藥劑防治稻瘟病，多次用藥時最好交替使用這些藥劑。

唑類殺菌劑水稻抽穗前后慎用咪唑類殺菌劑，用好了，防病增多；用不好，將影響抽穗灌漿。已唑醇與井岡霉素的復配劑如紋肅等，丙環唑、烯唑醇、噻呋酰胺單劑如敵力特、禾果利、滿穗等，這些藥持效期一般可達到15天以上，用于防治水稻紋枯病效果好。需要注意的是，戊唑醇、烯唑醇、已唑醇、丙環唑等唑類殺菌劑會抑制水稻體內赤霉素的形成，在水稻上部節間拔長期使用，特別是加量使用時，可能抑制節間拔長，導致抽穗困難，影響水稻灌漿結實。

草甘膦水稻孕穗期誤噴草甘膦危害大。誤將草甘膦施入雜交稻田，可導致水稻大面積受害，成片稻田不能正常抽穗，產量損失80%~100%。草甘膦屬內吸傳導型滅生性除草劑。幼穗分化部位易產生藥害，造成心葉枯死、幼穗畸形等癥狀。稻田誤噴草甘膦出現藥害后及時噴施適量赤霉素和磷酸二氫鉀，可在一定程度上促進幼穗生長發育，7天后可再噴施適量尿素。一般在水稻分蘗盛期、幼穗分化初期補救效果較好；到孕穗期，尤其是孕穗后期受藥害，穗軸基部變褐壞死，補救效果差。