防止玉米缺磷，可在缺磷土壤（速效磷10毫克/千克以下為極缺磷，10-20毫克/千克為中度缺磷）增施農家肥或磷肥，折合每畝施五氧化二磷5-10千克。農家肥、鈣鎂磷肥和磷礦粉可撒施，重過磷酸鈣和磷酸二銨可條施。苗期易缺磷的地塊，可用磷酸二銨等水溶性磷肥作種肥，折合每畝施五氧化二磷2-3千克，在播種前條施于播種溝內，種子不能與肥料接觸。玉米營養生長期缺磷，可噴施濃度為1-2%的過磷酸鈣、重過磷酸鈣或磷酸二銨溶液，或者在植株旁邊開溝追施磷肥。

玉米植株變紫色不一定都是由缺磷引起的。有極少數雜交種的幼苗即使不缺磷也呈紫紅色。還有個別雜交種就是在缺磷的情況下，幼苗也不表現紫紅色癥狀。一般缺磷植株高度低于正常植株，這是判斷雜交種玉米是否缺磷的重要方面。

正常苗顏色應該為綠色的玉米品種，幼苗顏色發紫，主要是因為體內糖代謝受阻，葉片中積累的糖分較多，并因此形成大量的花青素苷，使植株帶紫色。藥害、蟲害、栽培管理不當等不利于玉米苗生長、會使玉米苗體內糖代謝受阻的因素，都可能導致玉米苗顏色發紫，應查明原因，有針對性地采取救治措施。