要想冬小麥獲高產，施用種肥是不可忽視的。施種肥的作用主要是為麥苗提供所需的養分。當幼苗剛出來時，根系發育弱，吸收肥水的能力弱，而廣大北方麥區在冬小麥播種時，土溫已經較低，土壤自身的養分釋放緩慢，很可能出現養分供應不上的問題。而冬小麥苗期對于營養的需求數量雖然不多，但很敏感與嚴格，需要供應少而精的營養。因此，種肥的作用在于保證小麥苗齊苗壯，順利越冬，及時返青。這是冬小麥獲高產的關鍵之一。此時精施種肥可以提高麥苗抗旱抗寒能力，達到培育壯苗的目的。

種肥施什么肥料呢？種肥最需要的是磷肥。麥苗對磷肥的需要十分迫切，對于磷肥的反應敏感，苗期又是磷素營養的臨界期，此時如果供磷不足或嚴重缺磷，既會出現苗弱和苗不齊。在遇到干旱和寒冷時，還有凍死苗的問題；而過了苗期，以后即使再補施磷肥也不能彌補此時所造成的損失。

因此，種肥適宜的養分配比要以磷為主，配施少量的氮。肥料品種可選復合肥或單質肥。如西北和華北麥區常用的種肥品種有磷酸二銨，在二元復合肥中磷酸二銨和硝酸磷肥都可以用；而長江中下游麥區，最常用的種肥品種是低濃度的過磷酸鈣和適量硫酸銨為宜。但尿素、碳酸氫銨和氯化銨等都是不宜做種肥的。由于種肥適宜的養分配比是磷多氮少，通常不要選用高氮復合肥作種肥，以免引起苗不旺或燒苗問題。

種肥施用量多少為合理呢？種肥的用量不能多，要掌握少而精的原則，提倡精量施用。磷酸二銨以5公斤/畝為宜，雖然它數量不多，但可以起到“四兩撥千斤”的作用；過磷酸鈣以8公斤/畝為宜；硫酸銨不要超過5 公斤/畝為宜。

最后，種肥的施用方法和施肥的位置同樣很重要，無論采用機播方式還是畜播方式，種肥都不能直接與麥種接觸，要將化肥施在麥種的斜下方兩三厘米處，使麥種與常規化肥隔開才安全。