種子處理是有效防止病蟲入侵的第一道防線。為確保苗全、苗壯。處理方法如下：

玉米種子的挑選包括穗選和粒選。穗選即在場上晾曬果穗時，剔除混雜、成熟不好、病蟲、霉爛果穗后曬干脫粒做種用。粒選粒選即播前篩去小、秕粒，清除霉、破、蟲粒及雜物，使之大小均勻飽滿，利于苗全、苗齊。

種子處理曬種選晴天曬2~3天，利于提高發芽率，提早出苗，減輕絲黑穗病。

浸種可促進種子發芽整齊、出苗快、苗整齊。方法有冷水浸種12~24小時；50℃溫水浸泡6~12小時。浸種應注意飽滿的硬粒型種子時間可長些，秕粒、馬齒型種子時間宜短；浸過的種子勿曬、勿堆放、勿裝塑料袋；晾干后方可藥劑拌種；天旱、地干、墑情不足時，不浸種；浸過的種子要及時播種。

藥劑拌種可用15%粉銹寧可濕性粉劑400~600克拌100公斤種子防玉米絲黑穗病，也可用種衣劑拌種、包衣防治地下害蟲。