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一、適時收獲。貯藏用的馬鈴薯以干物質積累最多、塊莖充分成熟的時候收獲為好，春薯宜在6月上中旬收獲，秋薯則應在11月上旬收獲，不能受霜凍。無論春薯秋薯，收獲前如遇雨天，都應待土壤適當干燥后收獲。剛出土的塊莖，外皮較嫩，應在地面晾1-2小時，待薯皮表面稍干后再收集。但夏天不能久曬，收后應及時收藏在陰涼處。貯藏時應嚴格挑選，剔除有病變、損傷、蟲咬、雨淋、受凍、開豁、過小、表皮有麻斑的塊莖。
二、貯前處理。在馬鈴薯收獲前2-4周內，用濃度為0.2%的青鮮素進行葉面噴灑，可抑制薯塊貯藏期間發芽。如果噴藥后48-72小時內遇雨，應該補噴。
三、貯藏條件。⑴溫度：貯藏初期10-15天應保持在15-20℃的較高溫度，待塊莖表皮形成木栓化保護層后，將溫度控制在3-5℃進行貯藏。⑵濕度：貯藏的適宜相對濕度為90%左右。
四、貯藏方式
1、室內堆藏：選擇通風良好，場地干燥的倉庫，一般用筐裝薯塊，在室內堆碼貯藏；有的地方是直接將薯塊堆放在室內竹樓或樓板上；也有用袋子將薯塊裝入，堆放或掛在樓板上的。這些方法簡便易行，但難以控制發芽。若配合藥物處理，可提高貯藏效果。也可用覆蓋遮光的辦法抑制發芽，此法對多雨季節收獲的馬鈴薯的貯藏較為理想。薯堆中放若干竹制通氣筒，以利通風散熱。為提高空間利用率，最好在室內用尼龍編織袋包裝架藏，或者用筐箱、編織袋包裝碼垛堆藏。
2、窖藏：在南方溫暖地區，選擇避光、陰涼、通風、干燥的室內或室外棚下，用磚砌成長方形窖池，池壁留孔，成花墻式，以便通風散熱，上面覆蓋細沙土10-15厘米，稍加壓實即可。西北地區多用井窖或窯窖貯藏。這兩種窖的貯藏量可達3000-4000公斤。由于只利用窖口通風調節溫度，所以保溫效果較好。但入窖初期不易降溫，故應注意入窖前的預冷。
不論堆藏還是窖藏，都應注意初期要加強通風。主要在早晚氣溫較低時通風，也可用排風扇通風。經過數周，可不必過多地通風，視薯堆內溫度狀況適當通風，使薯堆內的溫度接近外界最低氣溫，但不能低于0℃。馬鈴薯進庫初期，隔2周左右就應檢查1次，剔除腐爛變質的塊莖。以后每隔1個月左右檢查1次。
