隨著新農村建設和現代農業的快速發展，大棚蔬菜發展又進入新一輪高峰。但新發展的大棚多由糧田直接調整而來，存在土壤肥力較差，不能滿足蔬菜生產優質、高產的需要；其次新菜農栽培管理技術水平較低，投入盲目性大，易于造成氮磷鉀等養分供應失調，土傳病蟲害發生嚴重等土壤障礙的問題。因此科學引導新菜農對新大棚菜田土壤培肥和管理成為當前急需解決的技術問題。土壤培肥改良的主要手段是增施有機肥。現將有機肥種類、特點及施用介紹如下：

農家肥：包括糞肥、餅肥、綠肥、秸稈還田、泥肥、堆肥、漚肥、廄肥、沼氣肥等。其具有原材料來源廣泛、易于就地取材、價格低廉、施用后不僅能為作物提供全面營養，且肥效長，可增加和更新土壤有機質，促進微生物繁殖，改善土壤的理化性質和生物特性等的優點，是蔬菜種植的良好肥料來源。

農家肥主要做底肥施用。新建大棚應多施農家肥，并進行全層撒施與土混勻，施肥深度10～20厘米，施用推薦量以每畝2000～5000公斤為宜。農家肥在施用前應進行堆腐發酵防止將害蟲卵、病原菌、雜草種子帶入菜田。

商品有機肥：是以畜禽糞便、動植物殘體、還包括不含合成添加劑的食品、工業的有機副產品，不含防腐劑的魚渣、牛羊毛廢料、骨粉、氨基酸殘渣、家禽家畜加工廢料、糖廠廢料等富含有機質的資源為主要原材料，采用工廠化方式生產的有機肥料，具有養分含量相對較高，質量穩定的特點。其主要種類及施用有：

精制有機肥料類（不含特定功能的微生物，以提供有機質和少量養分為主）一般作底肥施用，也可以用作追肥。做底肥一般根據土壤肥力不同以畝施300～1500公斤，同時配施傳統有機肥和少量的氮磷鉀復混肥效果會更佳。

生物有機肥料類（除含有較高的有機質和少量養分外，還含有特定功能的有益菌，如固氮、解磷、解鉀、抗土傳病害等）無毒無害，不污染環境，能通過特定微生物的生命活動增加作物的營養或產生作物生長刺激物質，促進作物生長，減少病害等，是大棚菜田首選的肥料。在施用時應與傳統有機肥和化肥配合施用以滿足蔬菜的營養需要。

有機無機復混肥料類（由有機和無機物料混合而成，既含有一定比例的有機質，又含有較高的養分，氮磷鉀總量≥15）養分含量較高，作底肥的用量應少于精制有機肥；還可根據情況做追肥施用。

微生物肥料：是指由有益微生物制成的，并富含活性微生物的特定制品。這類肥料的施用可以補充、促進有益微生物群體的繁殖，改善土壤微生態環境，抑制或控制土傳病蟲害的發生。其種類較多。其種類不同，其功效也各不相同。但微生物在土壤中要存活和大量繁殖發揮應有的作用需要有條件，其中土壤有機質是決定條件。微生物肥料不能代替化肥作用，蔬菜持續高產也不能過分依賴微生物肥料。

微生物肥料有液體和固體兩種。施用上可分為拌種、浸種、噴施、蘸根和灌根等多種方法。畝用量1～2公斤左右。