一、秋季穴施有機肥和復合肥，穴施就是在樹冠周圍或樹盤內，挖深40-60厘米、直徑50厘米的施肥穴。一般幼樹期間每株挖1-2個穴，初結果樹每株挖2-4個穴，盛果期大樹每株挖4-6個穴。將穴的底部先填入20厘米厚的腐熟粗有機物（如作物秸稈、細碎枝條等），然后把肥料和表土按照1:3的比例混合均勻后填入穴內（每穴施入復合肥100克），填滿后澆水沉實，待水滲下后把底土撒入地表面，并整平樹盤即可。每年施肥方向錯開，施肥量逐年增加。秋季采用穴施有機肥和復合肥，雖然施肥范圍小，但是肥料集中，可以有效地改良施肥穴的土壤，使施肥穴土壤肥沃，理化性狀好，為根系生長創造一個營養良好的環境。

二、生長期適時地下追肥。施肥方法是，在行間開深5-10厘米的條溝，將肥施入溝內，施肥后立即澆水。⑴采葉園。一年地下追肥3次：第一次在發芽前10天左右，每畝施尿素20-25千克；第二次在新梢生長高峰前（5月中旬），每畝施尿素25千克；第三次在8月上旬，每畝施多元復合肥20-25千克。⑵結果園。銀杏結果園由于樹齡有大有小，結果有多有少，樹勢有強有弱，樹體貯藏營養水平有高有低等復雜情況，因此追肥時應因樹因地制宜。幼樹（結果前）一年追肥2次：第一次在5月上中旬，每畝施尿素10-15千克；第二次在8月下旬至9月上旬，每畝施多元復合肥15千克。結果樹一年追肥4次：第一次在發芽前10天左右，每畝施尿素25千克；第二次于新梢生長高峰前7天左右（5月上中旬），每畝施尿素15-20千克、磷酸二氫鉀15千克；第三次在7月下旬至8月上旬，每畝施多元復合肥20千克；第四次在9月上中旬，每畝施多元復合肥15千克左右。

三、輔助葉面施肥。根據銀杏生長發育特點，全年一般可進行葉面噴肥6次；第一次在早春發芽前20天左右，噴3-5%的尿素溶液1次，可以有效地解決早春土溫低、根系活動晚、吸收能力差的問題；第二次在發芽后15天左右，噴0.2%尿素溶液，可促進幼葉生長，增加葉片的光合作用；第三次在5月中旬，噴0.5%尿素溶液，主要可以加速新稍生長,增加枝條當年的生長量；第四次在6月中旬，噴0.5%尿素溶液，以促新梢生長和花芽形成；第五次在7月上旬，噴0.3%磷酸二氫鉀溶液，可以延長新梢生長期，促進花芽形成；第六次在8月下旬，噴0.4%磷酸二氫鉀溶液，主要是提高葉片的光合功能和單葉鮮重，促進果實的生長發育。