苗期染該病后，幼葉呈紫銅色卷曲，葉片上有許多黑斑，葉片背面脈紫色失綠，莖稈產生退色條斑，病株生長緩慢或矮化、落葉、萎蔫、萎縮，產量下降，嚴重時植株直接萎蔫枯死，此癥狀很容易和條斑病毒混淆。番茄在結果期染病，果實表面出現退綠凸起環斑，輪紋不明顯，或呈瘤狀突起的褐色壞死斑，可造成病果脫落。如果果實成熟時染病，病斑輪紋明顯，退綠斑點在有色期最明顯，較嚴重時果實呈僵縮，病斑變褐壞死，臍部癥狀很容易和臍腐病相混淆，應注意識別。

對番茄斑萎病毒病，若不能對癥下藥，就很難得到有效防治。因此，很多菜農對番茄斑萎病毒病頭疼不已，番茄斑萎病毒病是通過植物寄主間自然傳播，主要是通過刺吸或害蟲，如蚜蟲、飛虱、薊馬傳播，同時，高溫、干旱也利于發病。田間管理差，農事操作中病健株相互摩擦，也可引起發病。目前還沒有對該病毒直接有效的防治措施，只能通過防治刺吸式害蟲、加強農事等措施進行防控。在棚室防治用15%異丙威熏蒸殺蟲，每畝用250克，同時鏟除雜草；棚室內可懸掛黃色粘蟲板防控，培育壯苗，拔除病株；番茄定植后，發現刺吸式害蟲，及時用10%吡蟲啉可濕性粉劑1500倍液防治，也可用25%阿克泰水分散粒劑1500倍液噴霧防治，噴藥時最好噴到莖基部，以殺滅根部幼蟲和蛹。用20%嗎啉胍?銅300倍液防治，或用香菇多糖300倍液防治，對番茄花葉病毒病、斑萎病毒病均有一定效果。