目前，Bt殺蟲劑與其他生物制劑復配的生物農藥，有更廣的殺蟲譜，受到群眾的廣泛歡迎。但Bt殺蟲劑在使用時一定要注意以下幾點：

1、在田間應用上，要確保殺蟲劑質量，要滿足Bt菌迅速生長的溫度條件，溫度越高，致病力越強。要避開強烈日光，因為紫外線對Bt菌會造成傷害，最好在下午4點以后施藥。

2、注意目標害蟲的生活習性和敏感性，寄主作物和環境條件及增效劑的應用等。例如，防治鉆蛀害蟲應在卵孵化盛期，施藥2~3次，特別是對螟蟲，防治效果好。螟蟲一旦蛀入莖中，防治效果就差。防治玉米螟，必須嚴格掌握在玉米心葉末期用藥，方能收到良好效果。防治棉鈴蟲，應掌握在排卵高峰后2～3天施藥，效果顯著。群眾有“治蟲不見蟲，打卵不打蟲”的防治經驗。這樣，幼蟲孵化時，一咬破卵殼就把殺蟲劑吃到了肚里，很快中毒死亡。Bt殺蟲劑殘效期一般可達7～10天。施藥后如果降雨，雨水會沖掉藥液，應該重新噴灑。

3、施藥方法可采用噴霧、噴粉、灌心、飛機噴灑等。無論哪種方法，務必施藥均勻，保證害蟲有吃食的機會，方能起到毒殺作用。

4、Bt殺蟲劑加入微量的化學殺蟲劑，或與其他微生物殺蟲劑混合施用，可以起到協同作戰的效果，能顯著提高害蟲的死亡率。