1）核DNA和線粒體DNA
1．當細胞培養到約107細胞/ml時，離心（5秒）收集細胞，再懸浮在70％乙醇中。
2．固定5分鐘或5分鐘以上，用水洗2次。
3．將細胞懸浮在含有50ng/ml的4，6-二脒基-2苯基吲哚的封固劑中。1mg/ml的4，6-二脒基-2苯基吲哚母液可在－20℃下貯存。
4．用紫外濾片觀察。
2）線粒體
1．在生長培養基中培養細胞達到約107細胞/ml時，加入100ng/ml 3，3’-二已基噁羰花青碘化物（DiOC6，Sigma D3652或Molecular Probes）用乙醇把1mg/ml母液稀釋到1/104。
2．培養5分鐘或5分鐘以上，用熒光素濾片觀察。
3）液泡
1．當細胞生長到約107細胞/ml時，離心收集細胞（5秒），懸浮在含有50mmol/L檸檬酸鈉（pH4.0）的YPD中。
2．加CDCFDA（羧基-2’,7’-二氯-熒光素雙乙酸鹽）到終濃度為10μmol/L。
3．保溫10分鐘或10分鐘以上，用熒光濾片觀察。
4）牙痕和幾丁質
1．用生長培養基培養細胞達107細胞/ml時，加100μg/ml Calcofluor（熒光發光劑28；Sigma F3543）（用水將1mg/ml母液稀釋到1/10，母液可在－20℃下黑暗保存數星期）。
2．培養5分鐘或5分鐘以上，用水洗2次，用紫外濾片觀察。