肥料是藥用植物生長不可缺少的重要物質，它對促進藥用植物生長發育，提高產量和質量，起著重要作用。但必須注意合理施肥，不能按傳統方法或沿用其他農作物的施肥方法進行套用濫施。現根據中藥村規范化生產“gap”有關規定，歸納以下幾點，供廣大藥農在生產時參考。
1.根據中藥材的品種特性施肥 中藥材因其種類、品種及其生長發育的階段不同，所需養分的種類、數量以及對養分的吸收強度也不相同。一般對于多年生的，特別是根莖類藥用植物，如白芍、大黃、黨參、牛膝、牡丹等，以施用充分腐熟的有機肥為主，增施磷鉀肥，配合使用化肥，以滿足整個生長周期對養分的需要；對于全草類中藥材，可適當增施氮肥；對于花、果實、種子類的中藥材，則應多施磷、鉀肥。在中藥材不同的生長階段施肥也不同，生長前期，多施氮肥，使用量要少，濃度要低；生長中期，氮肥的用量和濃度應適當增加；生長后期，多用磷、鉀肥，促進果實早熟、種子飽滿。
2.根據土壤特性施肥 （1）沙質土壤：要重施有機肥，如廄肥、堆肥、綠肥、土雜肥等，并摻加黏土，增厚土層，增強其保水肥能力。追肥應少量多次施用，避免一次使用過多而流失。（2）黏質土壤：應多施有機肥，并結合加施沙子、爐灰渣類，以疏松土壤，創造透水通氣條件，并將速效性肥料做種肥和早期追肥，以利提苗發棵。（3）兩合土壤：此類土壤兼有沙土、黏土的優點，是多數中藥材栽培最理想的土壤，施肥以有機肥和無機肥相結合，根據栽培品種的各生長階段需求合理施用。
3.根據天氣施肥 在低溫、干燥的季節和地區，最好施用腐熟的有機肥，以提高地溫和保墑能力，而且肥料要早施、深施，以充分發揮肥效。化學氮肥、磷肥和腐熟的有機肥一起做基肥、種肥和追肥施用，有利于幼苗早發，生長健壯。而在高溫、多雨季節和地區，肥料分解快，植物分解能力強，追肥不宜施得過早，而且應量少次多，以減少養分流失。
4.施肥原則 （1）以氮肥為主，磷、鉀肥配合施用。（2）以基肥為主，配合施用追肥和種肥。（3）以農家肥為主，農家肥與化肥配合施用。在施用農家肥的基礎上使用化肥，能夠取長補短，緩急相濟，不斷提高土壤的供肥能力。同時能提高化學肥料的利用率，克服單純施用化肥的副作用，以提高中藥材的質量。
1.根據中藥材的品種特性施肥 中藥材因其種類、品種及其生長發育的階段不同，所需養分的種類、數量以及對養分的吸收強度也不相同。一般對于多年生的，特別是根莖類藥用植物，如白芍、大黃、黨參、牛膝、牡丹等，以施用充分腐熟的有機肥為主，增施磷鉀肥，配合使用化肥，以滿足整個生長周期對養分的需要；對于全草類中藥材，可適當增施氮肥；對于花、果實、種子類的中藥材，則應多施磷、鉀肥。在中藥材不同的生長階段施肥也不同，生長前期，多施氮肥，使用量要少，濃度要低；生長中期，氮肥的用量和濃度應適當增加；生長后期，多用磷、鉀肥，促進果實早熟、種子飽滿。
2.根據土壤特性施肥 （1）沙質土壤：要重施有機肥，如廄肥、堆肥、綠肥、土雜肥等，并摻加黏土，增厚土層，增強其保水肥能力。追肥應少量多次施用，避免一次使用過多而流失。（2）黏質土壤：應多施有機肥，并結合加施沙子、爐灰渣類，以疏松土壤，創造透水通氣條件，并將速效性肥料做種肥和早期追肥，以利提苗發棵。（3）兩合土壤：此類土壤兼有沙土、黏土的優點，是多數中藥材栽培最理想的土壤，施肥以有機肥和無機肥相結合，根據栽培品種的各生長階段需求合理施用。
3.根據天氣施肥 在低溫、干燥的季節和地區，最好施用腐熟的有機肥，以提高地溫和保墑能力，而且肥料要早施、深施，以充分發揮肥效。化學氮肥、磷肥和腐熟的有機肥一起做基肥、種肥和追肥施用，有利于幼苗早發，生長健壯。而在高溫、多雨季節和地區，肥料分解快，植物分解能力強，追肥不宜施得過早，而且應量少次多，以減少養分流失。
4.施肥原則 （1）以氮肥為主，磷、鉀肥配合施用。（2）以基肥為主，配合施用追肥和種肥。（3）以農家肥為主，農家肥與化肥配合施用。在施用農家肥的基礎上使用化肥，能夠取長補短，緩急相濟，不斷提高土壤的供肥能力。同時能提高化學肥料的利用率，克服單純施用化肥的副作用，以提高中藥材的質量。