我國加入WTO后，隨著中藥現代化、國際化進程的推進，中藥正在走向世界，造福全人類，目前我國中藥已出口130多個國家。但我國生產的眾多傳統中藥產品，大多數不能符合國際醫藥的標準和要求，致使目前我國在國際市場上中藥銷售份額僅占5％左右。其原因之一是中藥材種植過程中防治病蟲害使用的農藥殘留超標問題。因此，按照中藥材GAP的要求，規范中藥材生產是提高產品質量和競爭力的需要。由于中藥材的栽培技術、生物學特性和藥用要求其生態條件具有特殊性，決定了中藥材病蟲害的發生和一般農作物相比有它自己的特點，中藥材規范化栽培(GAP)中病蟲害防治也應有針對性地采取相應措施。主要包括以下幾個方面：
一、農業防治技術
農業防治是指通過綜合運用栽培、管理技術措施，達到促進中藥材植物正常生長發育，減輕或防治病蟲害的目的。其主要方法有：
1、合理輪作和間作。合理的輪作和間作可減輕病蟲危害。不同科屬中藥材品種間進行輪作或中藥材植物與其他糧食、蔬菜作物輪作，如附子和水稻、玉米，大黃與黃芪，白術與禾本科植物通過3-4年的輪作，可減輕根腐病、白絹病、炭疽病等的危害。間作時應選擇和藥材植物發生的病蟲害不相同的作物進行間作，如附子田可間作菠菜或玉米，地黃田可間作玉米或芝麻。
2、深耕細作，清潔田園。很多病原菌和害蟲在土內越冬，因此通過冬耕不僅可直接破壞害蟲的越冬場所，減少越冬病蟲源，而且可使表層土內越冬的害蟲暴露于土表，被天敵寄生或取食，使其不能羽化出土；土內一部分病菌由于日光照射亦能被直接殺死，達到防病的目的。田間雜草是病蟲隱蔽及越冬場所，因此，清除雜草是病蟲隱蔽及越冬場所，因此，清除雜草和前茬作物集中燒掉或深埋，是防治病蟲害的重要農藝措施。如附子收獲后及時集中燒毀稿稈可有效防治鉆心蟲。
3、合理施肥和灌溉。合理施肥能有效促進中藥材植物的生長發育，增強抗病能力。生產實踐證明，偏施氮肥往往會加重病蟲危害，而增施磷肥和鉀肥，特別是鉀肥可以增強植物抗病性。如陰濕條件下常發生藥用植物的根腐病，若適當增施磷肥和鉀肥，少施氮肥，然后配以挖溝排水控制溫度的管理措施，可顯著減少爛根。因此，根據藥用植物特性采取有效的灌溉方式，也是防治病蟲害行之有效的方法。
二、生物防治技術
生物防治是指利用自然界中的生物因素來進行病蟲害防治，包括動物（昆蟲、螨類、鳥類、兩棲類等）、真菌、細菌、病毒等。主要方法有：
1、以蟲治蟲，利用天敵昆蟲防治害蟲。天敵昆蟲主要有瓢蟲、螳螂、草蛉、步行蟲、食蚜蠅、食蟲虻和各種寄生蜂、寄生蠅等。這些天敵害蟲在自然界里廣泛存在，對抑制中草藥植物害蟲起了不可忽視的作用。值得我們注意的是要保護這些益蟲，給它們提供良好的生存環境，使其能夠順利繁殖，代代相傳，達到控制蟲害的目的。
2、以微生物治蟲。即利用真菌、細菌、病毒等病原微生物來防治害蟲。目前應用的有蘇蕓金桿菌、殺螟桿菌、青蟲菌等各種制劑。
3、利用害蟲天敵動物治蟲。許多害蟲天敵如各種蛙類、益鳥等能捕食大量的害蟲。據研究，解剖一只蛙的食料中害蟲占70%以上，啄木鳥、杜鵑、喜鵲等鳥類也主要取食害蟲，可有效控制木本藥材植物的害蟲如天牛幼蟲、吉丁蟲、松毛蟲等。由此可見，我們應積極保護自然界中的有益動物，并創造條件加以繁殖和利用。
三、物理機械防治技術
利用人工方法、簡單的器械、溫度、光、電磁波、超聲波、核輻射等方法防治病蟲害即為物理機械防治。主要方法有：
1、人工捕殺。危害活動時間集中的害蟲可用人工捕殺。如在夏天雨后黃昏時捕殺剛出土的金龜子成蟲；在農事操作時摘取害蟲在植物上所產的卵和剛孵化的幼蟲。
2、燈光誘殺。在田間安裝黑光燈，利用害蟲的趨光性進行燈光誘殺，可誘殺到某些鱗翅目成蟲、葉蟬、金龜子等。
3、溫度滅菌、滅蟲。用溫水浸種或開水燙種，可防治由種子帶菌的病害，如防治薏苡種子表面攜帶的黑穗病菌孢子，可于播種前用60℃溫水浸種半小時或開水燙種5-8秒，防治效果達70%-85%。
四、化學防治技術
化學防治是應用化學藥劑進行藥用植物病蟲害的防治，具有作用快、效果好、使用方便等優點，是目前防治藥用植物病蟲害的重要手段。但如果使用不當易造成農藥殘留、環境污染和病蟲產生抗性等后果。所以，化學防治要做到科學用藥，其主要方法有：
1、根據病蟲害發生情況合理用藥。能不用藥的盡量不用藥，能少用藥的盡量少用藥，能兼治盡可能兼治，能用生物農藥盡量不用化學農藥，以達到減少污染或無污染的目的，保證藥材的高質量。如常用于防治灰霉病、白粉病、炭疽病的托布津和防治銹病、霜霉病和葉斑病的百菌清，整個生育期最多用藥次數不超過3次，最后1次用藥距采收不得少于15天。治蟲用的敵百蟲、辛硫磷和溴氰菊酯等各類農藥，全生育期最多用藥次數不超過3次，最后1次用藥距采收不得少于7天。
2、必需用藥時首先應篩選高效、低毒、低殘留的藥劑，同時應盡量減少用藥次數，僅在防治的關鍵時期用藥。如防治藥材苗期病害應在發病初期使用，防治食葉性害蟲應在幼蟲孵化盛期用藥。防治地下害蟲應采用藥劑浸種和拌種方法，結合耕作采用土壤消毒的方法。
3、使用化學藥劑中應盡可能避免對天敵的殺傷，或選擇對天敵較安全的農藥。施藥方法應注意對天敵的保護，如采用毒土和種子處理的方法。
一、農業防治技術
農業防治是指通過綜合運用栽培、管理技術措施，達到促進中藥材植物正常生長發育，減輕或防治病蟲害的目的。其主要方法有：
1、合理輪作和間作。合理的輪作和間作可減輕病蟲危害。不同科屬中藥材品種間進行輪作或中藥材植物與其他糧食、蔬菜作物輪作，如附子和水稻、玉米，大黃與黃芪，白術與禾本科植物通過3-4年的輪作，可減輕根腐病、白絹病、炭疽病等的危害。間作時應選擇和藥材植物發生的病蟲害不相同的作物進行間作，如附子田可間作菠菜或玉米，地黃田可間作玉米或芝麻。
2、深耕細作，清潔田園。很多病原菌和害蟲在土內越冬，因此通過冬耕不僅可直接破壞害蟲的越冬場所，減少越冬病蟲源，而且可使表層土內越冬的害蟲暴露于土表，被天敵寄生或取食，使其不能羽化出土；土內一部分病菌由于日光照射亦能被直接殺死，達到防病的目的。田間雜草是病蟲隱蔽及越冬場所，因此，清除雜草是病蟲隱蔽及越冬場所，因此，清除雜草和前茬作物集中燒掉或深埋，是防治病蟲害的重要農藝措施。如附子收獲后及時集中燒毀稿稈可有效防治鉆心蟲。
3、合理施肥和灌溉。合理施肥能有效促進中藥材植物的生長發育，增強抗病能力。生產實踐證明，偏施氮肥往往會加重病蟲危害，而增施磷肥和鉀肥，特別是鉀肥可以增強植物抗病性。如陰濕條件下常發生藥用植物的根腐病，若適當增施磷肥和鉀肥，少施氮肥，然后配以挖溝排水控制溫度的管理措施，可顯著減少爛根。因此，根據藥用植物特性采取有效的灌溉方式，也是防治病蟲害行之有效的方法。
二、生物防治技術
生物防治是指利用自然界中的生物因素來進行病蟲害防治，包括動物（昆蟲、螨類、鳥類、兩棲類等）、真菌、細菌、病毒等。主要方法有：
1、以蟲治蟲，利用天敵昆蟲防治害蟲。天敵昆蟲主要有瓢蟲、螳螂、草蛉、步行蟲、食蚜蠅、食蟲虻和各種寄生蜂、寄生蠅等。這些天敵害蟲在自然界里廣泛存在，對抑制中草藥植物害蟲起了不可忽視的作用。值得我們注意的是要保護這些益蟲，給它們提供良好的生存環境，使其能夠順利繁殖，代代相傳，達到控制蟲害的目的。
2、以微生物治蟲。即利用真菌、細菌、病毒等病原微生物來防治害蟲。目前應用的有蘇蕓金桿菌、殺螟桿菌、青蟲菌等各種制劑。
3、利用害蟲天敵動物治蟲。許多害蟲天敵如各種蛙類、益鳥等能捕食大量的害蟲。據研究，解剖一只蛙的食料中害蟲占70%以上，啄木鳥、杜鵑、喜鵲等鳥類也主要取食害蟲，可有效控制木本藥材植物的害蟲如天牛幼蟲、吉丁蟲、松毛蟲等。由此可見，我們應積極保護自然界中的有益動物，并創造條件加以繁殖和利用。
三、物理機械防治技術
利用人工方法、簡單的器械、溫度、光、電磁波、超聲波、核輻射等方法防治病蟲害即為物理機械防治。主要方法有：
1、人工捕殺。危害活動時間集中的害蟲可用人工捕殺。如在夏天雨后黃昏時捕殺剛出土的金龜子成蟲；在農事操作時摘取害蟲在植物上所產的卵和剛孵化的幼蟲。
2、燈光誘殺。在田間安裝黑光燈，利用害蟲的趨光性進行燈光誘殺，可誘殺到某些鱗翅目成蟲、葉蟬、金龜子等。
3、溫度滅菌、滅蟲。用溫水浸種或開水燙種，可防治由種子帶菌的病害，如防治薏苡種子表面攜帶的黑穗病菌孢子，可于播種前用60℃溫水浸種半小時或開水燙種5-8秒，防治效果達70%-85%。
四、化學防治技術
化學防治是應用化學藥劑進行藥用植物病蟲害的防治，具有作用快、效果好、使用方便等優點，是目前防治藥用植物病蟲害的重要手段。但如果使用不當易造成農藥殘留、環境污染和病蟲產生抗性等后果。所以，化學防治要做到科學用藥，其主要方法有：
1、根據病蟲害發生情況合理用藥。能不用藥的盡量不用藥，能少用藥的盡量少用藥，能兼治盡可能兼治，能用生物農藥盡量不用化學農藥，以達到減少污染或無污染的目的，保證藥材的高質量。如常用于防治灰霉病、白粉病、炭疽病的托布津和防治銹病、霜霉病和葉斑病的百菌清，整個生育期最多用藥次數不超過3次，最后1次用藥距采收不得少于15天。治蟲用的敵百蟲、辛硫磷和溴氰菊酯等各類農藥，全生育期最多用藥次數不超過3次，最后1次用藥距采收不得少于7天。
2、必需用藥時首先應篩選高效、低毒、低殘留的藥劑，同時應盡量減少用藥次數，僅在防治的關鍵時期用藥。如防治藥材苗期病害應在發病初期使用，防治食葉性害蟲應在幼蟲孵化盛期用藥。防治地下害蟲應采用藥劑浸種和拌種方法，結合耕作采用土壤消毒的方法。
3、使用化學藥劑中應盡可能避免對天敵的殺傷，或選擇對天敵較安全的農藥。施藥方法應注意對天敵的保護，如采用毒土和種子處理的方法。