消化共生 digestive symbiosis 棲息于動物消化器官內的微生物，以此動物所攝取食物的一部分或大部分作為自己的食物進行分解，據此，而動物得以把自身酶所不能消化的食物作為營養源，如此兩者互利共生，特稱為消化共生。棲息于白蟻腸中的超鞭毛蟲類（Trichonympha，Tricho－monas等）和細菌，將白蟻攝取的木屑中的纖維素、半纖維素分解成單糖和低級脂肪酸，供給白蟻作為能源和碳源。棲息于反芻動物瘤胃（第一反芻胃）中的細菌（Ruminococcus，Bacteroides等）和纖毛蟲（Entodinium，Isotricha，Diplodinium等）稱為瘤胃微生物，它可將動物攝取的青草和干草中的纖維素、半纖維素、淀粉等分解成低級脂肪酸。這些低級脂肪酸由瘤胃壁吸收，幾乎可作為機體的全部能源和碳源。一般，哺乳類、鳥類的腸內細菌也能協助蛋白質和糖的發酵，以助動物的消化。其中，田鼠的前胃，袋鼠、馬和嚙齒類的盲腸，雞、家鴿的腸盲囊等，都是使消化管的特定部位變成了發達的發酵室，對微生物的作用積極地加以利用。
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