子囊孢子 （ascospore） 指產(chǎn)生在子囊菌子囊內(nèi)的孢子。在即將形成孢子之前，子囊內(nèi)進行核融合和減數(shù)分裂，一般一個子囊內(nèi)產(chǎn)生8個孢子，普通為橢圓形，有的是針狀態(tài)體或帶有隔壁。在表面上可以看到紋、刺、網(wǎng)眼等。不同的特征，其顏色也各種各樣：有的無色，有的淡黃色、淡紅色、橙色、褐色及黑色等。普通在子囊內(nèi)并列成一排，其一半與另一半性別各 。（例如脈孢菌屬、麻孢殼屬、Pleurage）。孢子一般在子囊內(nèi)排成一列，其中半數(shù)與其他半數(shù)各為不同的性屬（例如Neurospora，Gelasinospora，Pleurage）。
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