當一個新的群體只由幾個個體建立起來時，就發生了隨機漂變的極端情況，即稱為奠基者效應(founder effect)。在海島生活的許多物種的群體，盡管現在已有幾百萬個個體組成，但它們往往都是很久以前偶然到來的一個或幾個移居者的后裔。湖泊、隔離的森林和生境中也有這種情況。如果這幾個移居者之間在某些基因座上的基因頻率的差別，大于這幾個移居者本來所屬群體之間的差別，則將對這些移居者后裔的進化產生持久的重大影響。人類群體中奠基者效應的一個近代例子是，美國一個州有一個由19世紀中期從德國遷來的27個家庭建立起來的一個教派。他們生活在自己的圈子里，幾乎不同周圍人群通婚。在幾個基因座上可以觀察到遺傳漂變的作用。如血型A(基因型I^AI^A，I^Ai)的頻率在德國人群為0．40到0．45，可是這個社團的德裔美國人群中為0．60，戶等位基因的頻率只有0．025。MN血型基因座上，M等位基因頻率在德國人和美國人群體都為0．54，可是這個社團的德裔美國人卻達0．65。