又稱同型合子或同質合子。由兩個基因型相同的配子所結合而成的合子，亦指由此種合子發育而成的生物個體。純合體的同源染色體，在其對應的一對或幾對基因座位上，存在著完全相同的等位基因，如AA、aa、AABB、AAbb、aaBB、AABBcc、aaBBcc等等，具有這些基因型的生物，就這些成對的基因來說，都是純合體。在它們的自交后代中，這幾對基因所控制的性狀，不會發生分離。