克隆嵌板法（clone panel method）是應用雜種細胞保留或丟失人染色體有時有重疊現象而設計的一種簡便有用的基因定位方法。如果某一表型特征只出現于克隆A、C而不見于B，就可決定該特征的基因只能在3號染色體上，因為A、C克隆都有3號染色體，而B克隆則無，其它亦可同理判斷這樣3個克隆可對8條（23=8）染色體作出判斷；如果是5個克隆（25=32）就可對人類22條常染色體和2條性染色體作出判斷。例如半乳糖激酶（GK）、尿苷-磷酸激酶（UMPK）和氨基已糖苷酶A（HEXA）的基因就是用此法分別定位于人的17號、1號和15號染色體上的。此外，還可對雜種細胞進行特殊染色，來識別雜種細胞中人和鼠染色體，以助基因定位。在體細胞雜交基礎上還發展了微細胞（micro cell）技術，即制備只含少數或一條人染色體的微細胞進行細胞雜交。也可將人中期染色體進行分離直接轉移到鼠類細胞中，使人染色體在受體細胞中裂解變成短的DNA片段，并整合到受體細胞的基因組中。如兩個基因同時整合進去，就證明它們的緊密連鎖關系。