將物體上的所有微生物包括細菌芽孢全部殺死或除去的措施。滅菌的方法有加壓滅菌、紫外線照射滅菌、過濾除菌和化學藥劑滅菌。加壓滅菌是在密封的高壓蒸氣鍋中進行的。當鍋里的蒸氣壓力上升到1.05公斤/平方厘米時，蒸汽溫度可達121℃。在此高溫下，連續20分鐘，可將微生物，包括細菌芽孢全部殺死。紫外線照射可引起微生物細胞DNA同一鏈上相鄰的兩個胸腺嘧啶形成二聚體，導致微生物的變異或死亡。過濾除菌是用細菌漏斗除去液體物質中的真菌、細菌等微生物的方法。有些物質如酶、維生素、糖類、蛋白質、有些毒素等由于不耐熱，用加熱等方法處理極易變質，可用此法除去微生物。化學藥劑滅菌是用一些化學物質殺死微生物。常用的化學藥劑有環氧乙烷等。環氧乙烷是一種化劑，能使酶等烷化而殺死微生物。
　　應用滅菌技術可對接種室、玻璃器皿、發酵罐、培養皿等進行滅菌，而這是進行微生物學研究和微生物工業生產所不可缺少的。滅菌技術也可用于醫學上手術器械等的滅菌。19世紀，法國廚師阿貝首先發現密封的果汁經煮沸后可長期保存，后采用加壓滅菌方法生產罐頭食品，使罐頭食品的生產有了可靠的衛生保證。化學滅菌劑環氧乙烷等還用于宇宙飛船等的滅菌。