編碼蛋白質的結構基因是在核漿中被轉錄的。但是核漿中的RNA卻并不像mRNA。核漿RNA要大得多，很不穩定，并且其順序的復雜性也要大得多。由于它的大小很不一致，故稱核內不均一RNA(hnRNA)。已經證明mRNA確實是從hnRNA生成的。細胞漿內的mRNA平均只有1800-2000個堿基。而哺乳動物的hnRNA平均有8000-10000個堿基，其范圍很廣泛，從2000-14000堿基均有，所以一般要比mRNA大4-5倍。如果以5倍計算，由于正常哺乳動物細胞中測得mRNA僅占hnRNA量的5%，則相當于有25%的hnRNA可轉變為mRNA。這意味著有3/4的hnRNA即在核內降解。hnRNA被切除內含子后即成為mRNA，并進入細胞漿內。但在切除內含子之前，hnRNA可先加帽和加poly(A)尾鏈。有一種稱為poly(A)聚合酶的酶可以用ATP為底物，以加上poly(A)尾鏈，這是hnRNA轉變為成熟的mRNA所必須的。在哺乳動物細胞中，僅約30%的hnRNA被多聚腺苷酸化，而mRNA中卻約70%是有poly(A)尾鏈的。可能多聚腺苷酸化是hnRNA分子要被加工的信號。hnRNA的尾端要被切去一段，然后才加上poly(A)。因為RNA聚合酶在轉錄時即已通過了相當于加上poly(A)的位點，故hnRNA尾端的多余部分要由內切核酸酶切去，才能加上poly(A)。