指實現(xiàn)免疫功能的器官和組織。主要包括胸腺、法氏囊或類囊器官、骨髓、淋巴結(jié)、脾臟、扁桃體、闌尾及腸集合淋巴組織等。因這些器官的重要成分是淋巴組織，故又稱為淋巴器官。它們的免疫功能是能產(chǎn)生淋巴細(xì)胞、濾過淋巴液或血液，參與免疫應(yīng)答。機(jī)體內(nèi)，除了上述有被膜包裹著、有一定形態(tài)的免疫器官外，還散布著許多無被膜的淋巴組織，它們主要分布在消化道和呼吸道粘膜，在免疫中也起著重要的作用。根據(jù)免疫器官發(fā)生和作用的不同，通常把它們分為中樞免疫器官和周圍免疫器官。
中樞免疫器官 又稱中樞淋巴器官。是對免疫應(yīng)答的發(fā)生起決定作用、能左右機(jī)體實現(xiàn)免疫應(yīng)答功能的器官，主要包括胸腺（所有的脊椎動物）、法氏囊（鳥類）及類囊組織，如骨髓等。發(fā)生在胚胎期早期，為淋巴樣上皮結(jié)構(gòu)。來自骨髓的原始的淋巴干細(xì)胞在中樞免疫器官中接受激素或激素樣物質(zhì)的刺激，或由于這些器官所提供的微環(huán)境，最終分化、成熟為具有免疫活性的細(xì)胞——T細(xì)胞和B細(xì)胞。T細(xì)胞和B細(xì)胞一旦形成，就被輸送到周圍免疫器官中。
周圍免疫器官 又稱周圍淋巴器官。包括淋巴結(jié)、脾臟及腸道相關(guān)淋巴組織等，在胚胎發(fā)育過程中出現(xiàn)比中樞免疫器官遲。其淋巴細(xì)胞是由中樞免疫器官遷來。因此可以說，周圍免疫器官是免疫活性細(xì)胞定居及增殖的場所，也是這些細(xì)胞產(chǎn)生抗體及發(fā)育成致敏淋巴細(xì)胞以及發(fā)揮免疫應(yīng)答的重要部位。中樞免疫器官對周圍免疫器官的發(fā)育起著主導(dǎo)作用。中樞免疫器官的缺損將嚴(yán)重影響免疫應(yīng)答。