食物殘渣在大腸內停留的時間較長，一般在十余小時以上，在這一過程中，食物殘渣中的一部分水分被大腸粘膜吸收。同時，經過大腸同細菌的發酵和腐敗作用，形成了糞便。糞便中除食物殘渣外，還包括脫落的腸上皮細胞和大量的細菌。此外，機體代謝后的廢物，包括由肝排出的膽色素衍生物，以及由血液通過腸壁排至腸腔中的某些金屬，如鈣、鎂、汞等的鹽類，也隨糞便排至體外。

　　正常的直腸通常是空的，沒有糞便在內。當腸的蠕動將糞便推入直腸時，刺激了直腸壁內的感受器，沖動經盆神經和腹下神經傳至脊髓腰骶段的初級排便中樞，同時上傳到大腦皮層，引起便意和排便反射。這時，通過盆神經的傳出沖動，使降結腸、乙狀結腸直腸收縮，肛門內括約肌舒。與此同時，陰部神經的沖動減少，肛門外括約肌舒張，使糞便排排出體外。此外，由于支配腹肌和膈肌的神經興奮，腹肌和膈肌也發生收縮，腹內壓增加，促進糞便的排出。正常人的直腸對糞便的壓力刺激具有一定的閾值，當達到此閾值時即可引起便意。

　　排便運動受大腦皮層的影響是顯而易見的，意識可以加強或抑制排便。人們對對便意經常予以制止，就使直腸漸漸地對糞便壓力刺激失去正常的敏感性，加之糞便在大腸內認定留過久，水分吸收過多而變得干硬，引起排便困難，這是產生便秘的最常見的原因之一。