根據細菌的研究與分析，對細菌中引起特異性保護作用的抗原成份提取純化，可以生產特異的抗原疫苗。例如腦膜炎雙球菌、流感桿菌中的多糖成份為可引起保護性抗體的部分，可提取后制成多糖疫苗。多糖疫苗的免疫原性需通過加入適當的吸附劑來提高。多糖疫苗中不含內毒素中的類脂A，故無毒性。然而多糖疫苗為化學成份，無細菌在體內繁殖，亦需大量多次接種。