在現代生活中，人們對食品色、香、味的要求越來越高。人們熟知的紅曲色素、葉綠素等天然色素，已經廣泛應用于農產品深加工和食品工業中。同時，天然色素絕大多數具有很優越的生理功能，這為它們的開發應用展現了廣闊的前景。
葉綠素及其衍生物不僅是優良的著色劑，還有一系列的功能特性。葉綠素的卟啉環與鎂離子的螯合穩定性不好，可以用銅或鋅置換鎂，這樣既可以增強色素的穩定性，又具有較好的水溶性。葉綠素銅鈉鹽可用于食品著色并具有解熱、止血等功能。
　紅曲色素主要產于我國福建、浙江和廣東等省，一般用于制酒和火腿腸著色等。紅曲中如果含有一定濃度的能夠抑制膽固醇的功能成分———莫那克林K，則稱為功能紅曲。據悉，美國已開始從中國進口功能紅曲，作為食物補充劑推向市場；歐洲從中國進口紅曲是將它作為食品配料，用于火腿腸的生產。因此，我國紅曲，包括紅曲米和紅曲米粉產品，已經展現出極好的市場前景。
但與合成色素相比，天然色素在諸多方面尚不能盡如人意，特別是對光、熱及pH值的敏感性較高，對氧化、還原及微生物作用的敏感性較大。如何克服因此帶來的褪色、變色等問題，是天然色素科研的重要課題。
類胡蘿卜素受水分、光及溫度的影響很大，主要表現為氧化劣變和非氧化劣變。氧化劣變分為：非酶氧化（復合氧化、金屬離子催化氧化、純氧氧化）和酶氧化（脂肪氧化酶氧化、脂肪過氧化酶氧化、過氧化酶氧化）。而非氧化劣變有:順－反異構化、環氧化合物異構化。
　例如：β－胡蘿卜素中具有維生素A活性的黃色素分子，有許多不飽和雙鍵對光、氧和熱敏感，易發生降解；梔子黃是自然界難得的水溶性類胡蘿卜素，對食品染色性好，但耐光、耐熱性差，用于食品時會變成綠色；花色甙色素極不穩定，易在花色素酶作用下水解，迅速分解并褪色，在加工及保藏中受酸度、加熱、氧化、還原、糖、光、金屬離子和抗壞血酸等影響，發生褪色與褐變。另外，抗壞血酸自然氧化產生的脫氧抗壞血酸及過氧化氫，也對花色甙的褪色、變色有較大影響。如：葡萄皮提取色素水溶性好，在酸性下為紅色，在中性和堿性下則呈藍色，對熱和光不穩定，金屬離子可使其變色；紅曲紅極易對蛋白質染色，但耐光性差，在熒光燈下也會褪色；甜菜紅耐光耐熱性差，100℃條件下，其紅色漸漸消退而變成淡黃色、褐色，氧也可引起其褪色或褐變。
　　無論是哪種色素，都必須要考慮兩個大問題：色素本身的品質以及如何提高它們的穩定性。上海健鷹食品科技研究所通過深入的科學實驗和廣泛的市場調研，研制、購進了部分在農產品深加工和食品工業中用量大的高性能優質色素。同時，為提高天然色素的穩定性，上海健鷹食品科技研究所新研制出了有著廣泛護色適應性的護色劑F型，可使天然色素的耐光、耐熱性能大大增強。