廣州白云機場海關近兩年積極推進區域通關改革和區域海關合作，努力打造區域通關品牌，進一步增強機場空港的龍頭作用帶動物流發展，促進貨物跨省區、跨關區快速流動。目前，該關已與泛珠9省15個直屬海關實行了“多點報關，機場驗放”通關模式；與海口、南昌、南寧、成都、貴陽、廈門、昆明、福州、長沙、拱北、江門、深圳、黃埔等直屬海關實行了“屬地申報，口岸驗放”模式。2006年至2007年3月，白云機場海關辦理跨關區“屬地申報，口岸驗放”貨物488票，貨值3460萬美元。

　　據了解，“屬地申報，口岸驗放”是指符合海關規定條件的A類企業，在其貨物進出口時，可以自主選擇向其屬地海關申報，并在貨物實際進出境地的口岸海關（白云機場海關）辦理貨物驗放手續的一種通關方式。該模式可實現“當天申報、當天驗放”，對無需查驗的貨物，通關時間僅為30分鐘；而采用傳統的通關模式，一般需要1至1.5個工作日。企業選擇“屬地申報、口岸驗放”新通關方式，不僅減少了來往屬地海關與口岸海關之間的奔波之苦，還減少了轉關環節手續，節約了通關時間和通關成本，提高了跨關區物流運轉效率。   

　　白云機場海關以“通得快，管得住”為目標，大力提升海關監管庫區的運作效能，理順庫區內轉關等作業流程，搭建新的運行機制和監管模式，促進國際航空物流的快速健康發展。2006年3月28日新快件中心啟用后，該關及時出臺了《廣州白云機場海關關于快件中心車輛、貨物和物品進出海關監管庫區管理辦法（暫行）》、《快件航空貨物管理辦法》等，開通了出口航空快件直航業務，既保證快件貨物流轉順暢，又保證了庫區原有業務的有序進行，空運快件業務量增長了2倍。

　　此外，該關還推動“卡車航班”、空陸空聯運業務的進一步發展，現已開通“卡車航班”和“空陸聯運”線路20條，充分發揮香港、澳門與泛珠9省區經貿合作的橋梁紐帶作用，為促進泛珠三角區域大物流的發展發揮了作用。