1． 根的形態
龍眼有嫁接苗和圈枝苗。嫁接苗的根系由主根、側根、須根組成。圈枝苗主根不明顯。須根是吸收養分最活躍的部位，稱吸收根，有根毛。根據根系分布情況又可分為水平根和垂直根。新根白色，后漸變黃白，至須根時轉為黃褐色，皮孔粗密而明顯。有菌根。菌根較吸收根腫大，無根毛。幼嫩菌根或菌根基部呈黃褐色。菌根形態為總狀分枝式，或由于間歇生長而呈念珠狀。菌根的存在使龍眼得以適應丘陵山地紅壤旱、硬、瘠薄的惡劣環境。
龍眼根系的分布范圍因土壤、地下水位和管理措施的不同而異。在土層深厚、地下水位較低的紅壤山地，垂直根分布可達2-3米。水平根的擴展范圍較寬，大多比樹冠大1-2.8倍。土壤條件好，大部分吸收根分布在10-100厘米的土壤中，且多數在20-50厘米以內。
2． 根的生長習性
龍眼根系在適宜的條件下可周年生長沒有自然休眠期。一年中枝梢有幾次生長，根系生長也相應有幾次，新根新梢交替生長，新根的生長高峰多出現在新梢充實之后或萌芽之前。一年中根系生長有3-4次高峰。據福建省果樹研究所在莆田對30年生烏龍嶺龍眼觀察，全年有吸收根生長活動。其中4月中旬以前吸收數量很少，4月中旬至5月中旬花穗迅速增長和開花期間，吸收根生長有下降趨勢；6月下旬至7月下旬夏梢萌發高峰，吸收根數量又下降；8月上旬夏梢充實后，吸收根又明顯增加；果實采收后至10月中下旬，秋梢已充實，吸收根數量開始明顯減少；12月下旬至翌年1月下旬新梢抽生前，新根數量有明顯增加。
根系生長次數、數量和健壯程度受土壤、水分狀況以及當年地上部枝梢生長和結果量的影響。土溫100C，根系開始活動，隨土溫升高，根系活動加速，23-280C為生長最適溫度。土壤水分充足，根系活動力強，如6-8月高溫多濕季節，根系生長量最多，生長季節遇干旱，根系生長量減少。枝梢生長最大，根系生長量也大。結果過多，會抑制根的生長發育，降低根系吸收營養物質的能力，這是導致樹體衰退和大小年結果的原因之一。
