爛果是辣椒栽培中的常見現象，許多病害都能引起辣椒爛果，但病源不同，癥狀各異，防治方法也不一樣。因此，防治辣椒爛果須對癥。
    1．軟腐病引起的爛果：初呈水漬狀暗綠色斑，后全果軟腐，有惡臭味，果皮變白，干縮后脫落或掛在枝上。其他部位癥狀很少。可噴施72%農用鏈霉素4000倍液或50%DT殺菌劑500倍液，每7天1次，連噴2~3次。棉鈴蟲、煙青蟲是傳病媒介，要及時用菊酯類農藥噴殺。
    2．疫病引起的爛果：多數先從蒂部染病，呈水漬狀灰綠色斑．后迅速變褐軟腐。潮濕天氣，表面長出稀疏的白色霉層，病果干縮不脫落。其他部位如莖杈枝葉上，常有水漬狀褐斑。可噴64%殺毒礬與55％瑞毒霉混合液（50公斤水中，兩藥各加100克），或58%甲霜靈錳鋅400倍液，每7天1次，連噴2~3次。
    3．灰霉病和菌核病引起的爛果：灰霉病以門椒、對椒發病較多，在幼果頂部或蒂部出現褐色水漬狀病斑，后凹陷腐爛，呈暗褐色，表面出現灰色霉層，其他部位癥狀較少。菌核病由果柄發展到全果，呈水漬狀腐爛，淺灰褐色，其他部位也有相似的癥狀。濕度大時可用速克靈煙劑熏，濕度不大時可選噴速克靈、菌核凈或50％速克靈與70%甲基托布津混合液（60公斤水中兩藥各加50克），每6天1次，連噴2~3次。
    4．炭疽病引起的爛果：果實接近成熟時易染此病。初呈水漬狀黃褐色圓斑，中央灰褐色，上有稍隆起的同心輪紋，常密生小黑點。潮濕時，病斑表面常溢出紅色粘稠物；干燥時，病部干縮成膜狀，易破裂露出種子。葉片染病，初為水漬狀褪綠斑點，后變為邊緣褐色、中部淺灰色的小斑。可選噴百菌清、甲基托布津等，每7天1次，連噴2~3次。
    5．黑霉病引起的爛果：一般果頂先發病，也有的從果面開始，初期病部顏色變淺。果面漸漸收縮，并生有綠黑色霉層。可噴50%DT殺菌劑500倍液或58%甲霜靈錳鋅400倍液，每7天1次，連噴2~3次。
    6．臍腐病引起的爛果：果實臍部受害，初呈暗綠色水漬狀斑，后迅速擴大，皺縮，凹陷，常因寄生其他病菌而變黑或腐爛。可于坐果后噴灑1%過磷酸鈣或0．1%氯化鈣。如病部變黑或腐爛，可按黑霉病或軟腐病防治。